北京8月4日電 (記者 孫自法)在生命科學領域,基因組編輯技術的迅速發展和廣泛應用,為基礎研究和應用開發提供強大的技術支撐。不過,大片段DNA(脫氧核糖核酸)編輯一直面臨重大挑戰,對數千乃至數百萬鹼基的精準操縱更是基因編輯領域的核心難題,備受關注。 育種和基因治療有巨大應用潛力 來自中國科學院遺傳與發育生物學研究所(遺傳發育所)的消息說,該所高彩霞研究員團隊最新研發出一種新型可編程的染色體編輯技術(Programmable Chromosome Engineering,PCE)。該技術在動植物中實現了從千鹼基到兆鹼基級別DNA的多類型染色體精準操縱,顯著提升了真核生物基因組的操縱尺度和能力。 利用大片段DNA精準操縱技術,研究人員不僅能實現多基因疊加編輯,還可通過操控基因組結構變異,為作物性狀改良和遺傳疾病治療開闢新路徑。同時,該技術有望推動新型育種策略的發展,例如通過操縱遺傳連鎖、調控重組頻率實現育性控制,以及消除連鎖累贅,充分釋放野生種質資源中優異等位基因的育種潛力。此外,精準染色體編輯技術的突破將加速人工染色體構建,在合成生物學等新興領域也有重要的應用前景。 本項研究PCE系統的開發和精準染色體編輯示意圖。中國科學院遺傳發育所 供圖 這項攻克大片段DNA精準編輯的重要成果論文,北京時間8月4日深夜在國際知名學術期刊《細胞》(Cell)上線發表。審稿人評價認為,中國團隊發表的研究工作,代表了基因工程領域的重大突破,在育種和基因治療方面具有巨大的應用潛力。 系統應用受到3個關鍵問題制約 論文通訊作者高彩霞研究員介紹說,以基因編輯工具CRISPR及其衍生技術為代表的編輯系統,通過可編程的嚮導RNA(核糖核酸)引導Cas9等核酸酶靶向基因組特定位點,已廣泛應用於特定鹼基和短片段DNA的精準編輯。但針對大片段DNA編輯,現有工具在編輯效率、尺度、精準性及類型多樣性等方面仍存在明顯不足。 研究團隊發現,位點特異性重組酶(Cre-Lox)系統具有染色體水平DNA操縱潛力,其原理是在基因組中引入Lox序列後,由Cre重組酶介導Lox位點之間的DNA重組來實現全基因組範圍內的遺傳操縱。 然而,Cre-Lox系統的應用受到3個關鍵問題的制約:Lox位點固有的對稱性導致重組反應可逆,不利於目的編輯的發生;Cre酶作為四聚體工作,提升其活性的工程改造難度高;重組後特異性位點殘留,影響編輯的精準性。 構建兩個可編程染色體編輯系統 高彩霞指出,為逐一突破上述限制,在本項研究中,研究團隊構建出系統性技術路徑:首先,開發高通量重組位點快速改造平臺,並提出不對稱Lox位點設計原則,成功創製新型Lox變體,保持高效重組效率的同時將可逆重組活性降低至陰性對照水平。 其次,基於研究團隊此前自主開發的融合蛋白通用逆摺疊模型、結構與進化約束信息的蛋白定向進化平臺AiCE,實現對Cre蛋白多聚化界面的精準優化,獲得重組效率提升至3.5倍的工程化Cre蛋白變體。 最後,研究團隊創建並優化了重組酶的無痕編輯策略Re-pegRNA,利用引導編輯器的高效編輯特性,通過設計特異性pegRNA對重組後殘留的Lox位點進行「重引導編輯」,將其精準替換為原有基因組序列。 通過這三項技術的集成優化,研究團隊成功構建PCE與RePCE兩個可編程染色體編輯系統,可對不同Lox位點的插入位置和方向進行靈活編程,實現鹼基從千比特(kb)到兆比特(Mb)尺度的大片段DNA精準無痕操縱。 研究團隊表示,他們在動植物細胞中,利用新研發的系統已成功實現18.8 kb超大片段DNA的定點整合、5 kb序列的定向替換、12 Mb的染色體倒位、4 Mb的染色體刪除及整條染色體的易位。他們還利用新型大片段DNA精準操縱技術,成功創製含315 kb精準倒位的抗除草劑水稻種質,展示出其廣泛應用前景。 據了解,AiCE成果7月上旬已在線發表於《細胞》,並將與此次研究成果以背靠背形式於8月下旬在《細胞》紙質版正式刊出。(完)
8月3日清晨,大別山青龍嶺晨霧繚繞,山腳下的河南省信陽市新縣田鋪大壪已經忙碌起來,「老家寒舍」民宿店店主韓光瑩開始整理客房。「客人退房後,我就得及時更換床單、打掃衛生,為迎接下一波遊客做準備。」 田鋪大壪所在的新縣,是全國著名的革命老區和將軍縣。至今,層巒疊翠的田鋪大壪後山上還保留著劉鄧大軍在此戰鬥的遺址。來自各地的遊客,在這裡尋紅色足跡,賞綠色山水。 遊客在田鋪大壪遊玩拍照(央廣網發 餘俊 攝) 2019年9月16日,習近平總書記在田鋪大壪考察調研時,來到韓光瑩家,同韓光瑩一家圍坐在一起交談。總書記說,依託豐富的紅色文化資源和綠色生態資源發展鄉村旅遊,搞活了農村經濟,是振興鄉村的好做法。 「總書記非常親切,非常平易近人,他的話語飽含了對我們革命老區的深情厚望,也飽含了對老區人民的深切關懷。」回想起當時與總書記交談的情景,韓光瑩至今激動不已。作為紅軍的後代,韓光瑩閒暇時,喜歡跟遊客介紹當地革命先烈的故事。這幾年,韓光瑩還拍攝短視頻發布到社交平臺,把家鄉山水推介給各地網民。 田鋪大壪依山傍水,房屋與梯田、樹木錯落交織,風景秀麗。在發展鄉村旅遊過程中,田鋪大壪不搞大拆大建,而是講好本地的紅色故事,突出當地黃牆黛瓦的建築特色,保留好傳統村落的歷史風貌。「村東頭這三間老房子沒有經過修繕,就是為了讓大家記住鄉愁。」田鋪社區黨支部書記韓啟俊說。 田鋪大壪保留著傳統村落的面貌(央廣網記者 王勇生 攝) 古樸的豫南傳統村落、浸潤著革命熱血的紅色遺址,這些年不斷吸引遊客前來參觀遊覽。將自家庭院改造成農家樂的村民許秀青,也嘗到了幸福滋味。「節假日來就餐的客人特別多,根本忙不過來。一年我家農家樂的收入有一二十萬元,在家就能掙到錢,特別高興。」許秀青邊備菜邊笑道。 從外地返鄉的「90後」扶銀廷和妻子,在田鋪大壪創辦了一家「文創工坊」。「像鞋墊、虎頭枕、虎頭帽這些手工製品,都是我們當地一些老人、大姐手工做的。這些特色的文創產品既能讓遊客了解當地本土文化,又增加了村民收入。」扶銀廷說。 扶銀廷整理手工繡花鞋墊(央廣網記者 王勇生 攝) 近年來,田鋪大壪圍繞全面推進鄉村振興,發展鄉村旅遊、特色種植、文創等特色產業,持續拓寬群眾增收渠道。目前,全村已開辦20餘家特色小店、23家民宿及11家農家樂。2024年,田鋪大壪接待遊客66萬人次,旅遊綜合收入3200餘萬元。 「下一步,田鋪鄉將依託田鋪大壪等景區,連點成線,大力發展鄉村旅遊,傾力打造將軍故裡、全景田鋪,把更多好山好水變成好產業,讓鄉親們的腰包更鼓、笑容更甜。」田鋪鄉黨委副書記吳萌說。 總監製:駱紅秉 總策劃:張軍 於鋒 監製:伍剛 宮歆慧 蔡榮波 統籌:陶玉德 策劃:安琪 卜葉 記者:王勇生 張麗娜 配音:王勇生 鳴謝:新縣融媒體中心
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