北京8月4日電 (記者 孫自法)在生命科學領域,基因組編輯技術的迅速發展和廣泛應用,為基礎研究和應用開發提供強大的技術支撐。不過,大片段DNA(脫氧核糖核酸)編輯一直面臨重大挑戰,對數千乃至數百萬鹼基的精準操縱更是基因編輯領域的核心難題,備受關注。 育種和基因治療有巨大應用潛力 來自中國科學院遺傳與發育生物學研究所(遺傳發育所)的消息說,該所高彩霞研究員團隊最新研發出一種新型可編程的染色體編輯技術(Programmable Chromosome Engineering,PCE)。該技術在動植物中實現了從千鹼基到兆鹼基級別DNA的多類型染色體精準操縱,顯著提升了真核生物基因組的操縱尺度和能力。 利用大片段DNA精準操縱技術,研究人員不僅能實現多基因疊加編輯,還可通過操控基因組結構變異,為作物性狀改良和遺傳疾病治療開闢新路徑。同時,該技術有望推動新型育種策略的發展,例如通過操縱遺傳連鎖、調控重組頻率實現育性控制,以及消除連鎖累贅,充分釋放野生種質資源中優異等位基因的育種潛力。此外,精準染色體編輯技術的突破將加速人工染色體構建,在合成生物學等新興領域也有重要的應用前景。 本項研究PCE系統的開發和精準染色體編輯示意圖。中國科學院遺傳發育所 供圖 這項攻克大片段DNA精準編輯的重要成果論文,北京時間8月4日深夜在國際知名學術期刊《細胞》(Cell)上線發表。審稿人評價認為,中國團隊發表的研究工作,代表了基因工程領域的重大突破,在育種和基因治療方面具有巨大的應用潛力。 系統應用受到3個關鍵問題制約 論文通訊作者高彩霞研究員介紹說,以基因編輯工具CRISPR及其衍生技術為代表的編輯系統,通過可編程的嚮導RNA(核糖核酸)引導Cas9等核酸酶靶向基因組特定位點,已廣泛應用於特定鹼基和短片段DNA的精準編輯。但針對大片段DNA編輯,現有工具在編輯效率、尺度、精準性及類型多樣性等方面仍存在明顯不足。 研究團隊發現,位點特異性重組酶(Cre-Lox)系統具有染色體水平DNA操縱潛力,其原理是在基因組中引入Lox序列後,由Cre重組酶介導Lox位點之間的DNA重組來實現全基因組範圍內的遺傳操縱。 然而,Cre-Lox系統的應用受到3個關鍵問題的制約:Lox位點固有的對稱性導致重組反應可逆,不利於目的編輯的發生;Cre酶作為四聚體工作,提升其活性的工程改造難度高;重組後特異性位點殘留,影響編輯的精準性。 構建兩個可編程染色體編輯系統 高彩霞指出,為逐一突破上述限制,在本項研究中,研究團隊構建出系統性技術路徑:首先,開發高通量重組位點快速改造平臺,並提出不對稱Lox位點設計原則,成功創製新型Lox變體,保持高效重組效率的同時將可逆重組活性降低至陰性對照水平。 其次,基於研究團隊此前自主開發的融合蛋白通用逆摺疊模型、結構與進化約束信息的蛋白定向進化平臺AiCE,實現對Cre蛋白多聚化界面的精準優化,獲得重組效率提升至3.5倍的工程化Cre蛋白變體。 最後,研究團隊創建並優化了重組酶的無痕編輯策略Re-pegRNA,利用引導編輯器的高效編輯特性,通過設計特異性pegRNA對重組後殘留的Lox位點進行「重引導編輯」,將其精準替換為原有基因組序列。 通過這三項技術的集成優化,研究團隊成功構建PCE與RePCE兩個可編程染色體編輯系統,可對不同Lox位點的插入位置和方向進行靈活編程,實現鹼基從千比特(kb)到兆比特(Mb)尺度的大片段DNA精準無痕操縱。 研究團隊表示,他們在動植物細胞中,利用新研發的系統已成功實現18.8 kb超大片段DNA的定點整合、5 kb序列的定向替換、12 Mb的染色體倒位、4 Mb的染色體刪除及整條染色體的易位。他們還利用新型大片段DNA精準操縱技術,成功創製含315 kb精準倒位的抗除草劑水稻種質,展示出其廣泛應用前景。 據了解,AiCE成果7月上旬已在線發表於《細胞》,並將與此次研究成果以背靠背形式於8月下旬在《細胞》紙質版正式刊出。(完)
根據美國政府7月30日頒布的行政令,美國從8月6日起對巴西輸美產品加徵40%的從價關稅,這意味著,大部分巴西輸美產品的關稅稅率高達50%。當前在巴西對美國出口中,海鮮是受到美國關稅較大影響的產品之一。有數據顯示,巴西每年海鮮出口的約七成銷往美國市場。總臺記者日前探訪了巴西東北部海鮮出口重鎮納塔爾。在美國的高額關稅下,這裡的海鮮出口受到嚴重衝擊,許多企業被迫停工,大部分漁船暫停出海捕撈。總臺記者 雷湘平:我現在正在巴西東北部海鮮主產地納塔爾的一個海鮮加工廠。最近,美國關稅政策導致該工廠的產能被縮減至不足日常的一半,對美產品出口基本上處於停滯的狀態。可以看到,現在這個車間變得非常冷清,而以往這裡是非常繁忙熱鬧的加工場景。美國的高額關稅,讓這家有超過50年歷史的海鮮加工廠陷入困境。過去,這裡帶動了當地300多人的就業。如今,車間空了大半,一些機器停擺,在崗員工數量大大減少。納塔爾一海鮮加工出口公司負責人 阿里馬爾·弗朗薩·菲略:這是我們加工所有出口到美國海鮮的車間。過去的情況是我們早上卸下的海鮮,第二天早上就已送到美國邁阿密,供應美國市場。我們有非常高效的產品即時供應能力。如今如你們所見,車間一切都停了下來。這家海鮮加工產的困境,是納塔爾海鮮出口業的縮影。出口停滯,捕撈業也遭遇寒冬。納塔爾所在的北大河州有超過2.3萬名漁民。路易斯捕魚25年,眼下漁船不再出海,他的收入受到嚴重影響。納塔爾當地漁民 路易斯·卡洛斯·席爾瓦:現在情況越來越困難了,我們漁民的收入由底薪加提成構成。現在不能出海,沒有提成,只拿底薪,就讓生活變得很困難。納塔爾一海鮮加工出口公司負責人 阿里馬爾·弗朗薩·菲略:現在當地超過70%的船隊,無論是近海還是遠洋捕撈船,都已停止作業。實際上我們沒有太多可做的,要麼尋找新的市場,要麼產品沒有銷路。
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