北京8月4日電 (記者 孫自法)在生命科學領域,基因組編輯技術的迅速發展和廣泛應用,為基礎研究和應用開發提供強大的技術支撐。不過,大片段DNA(脫氧核糖核酸)編輯一直面臨重大挑戰,對數千乃至數百萬鹼基的精準操縱更是基因編輯領域的核心難題,備受關注。 育種和基因治療有巨大應用潛力 來自中國科學院遺傳與發育生物學研究所(遺傳發育所)的消息說,該所高彩霞研究員團隊最新研發出一種新型可編程的染色體編輯技術(Programmable Chromosome Engineering,PCE)。該技術在動植物中實現了從千鹼基到兆鹼基級別DNA的多類型染色體精準操縱,顯著提升了真核生物基因組的操縱尺度和能力。 利用大片段DNA精準操縱技術,研究人員不僅能實現多基因疊加編輯,還可通過操控基因組結構變異,為作物性狀改良和遺傳疾病治療開闢新路徑。同時,該技術有望推動新型育種策略的發展,例如通過操縱遺傳連鎖、調控重組頻率實現育性控制,以及消除連鎖累贅,充分釋放野生種質資源中優異等位基因的育種潛力。此外,精準染色體編輯技術的突破將加速人工染色體構建,在合成生物學等新興領域也有重要的應用前景。 本項研究PCE系統的開發和精準染色體編輯示意圖。中國科學院遺傳發育所 供圖 這項攻克大片段DNA精準編輯的重要成果論文,北京時間8月4日深夜在國際知名學術期刊《細胞》(Cell)上線發表。審稿人評價認為,中國團隊發表的研究工作,代表了基因工程領域的重大突破,在育種和基因治療方面具有巨大的應用潛力。 系統應用受到3個關鍵問題制約 論文通訊作者高彩霞研究員介紹說,以基因編輯工具CRISPR及其衍生技術為代表的編輯系統,通過可編程的嚮導RNA(核糖核酸)引導Cas9等核酸酶靶向基因組特定位點,已廣泛應用於特定鹼基和短片段DNA的精準編輯。但針對大片段DNA編輯,現有工具在編輯效率、尺度、精準性及類型多樣性等方面仍存在明顯不足。 研究團隊發現,位點特異性重組酶(Cre-Lox)系統具有染色體水平DNA操縱潛力,其原理是在基因組中引入Lox序列後,由Cre重組酶介導Lox位點之間的DNA重組來實現全基因組範圍內的遺傳操縱。 然而,Cre-Lox系統的應用受到3個關鍵問題的制約:Lox位點固有的對稱性導致重組反應可逆,不利於目的編輯的發生;Cre酶作為四聚體工作,提升其活性的工程改造難度高;重組後特異性位點殘留,影響編輯的精準性。 構建兩個可編程染色體編輯系統 高彩霞指出,為逐一突破上述限制,在本項研究中,研究團隊構建出系統性技術路徑:首先,開發高通量重組位點快速改造平臺,並提出不對稱Lox位點設計原則,成功創製新型Lox變體,保持高效重組效率的同時將可逆重組活性降低至陰性對照水平。 其次,基於研究團隊此前自主開發的融合蛋白通用逆摺疊模型、結構與進化約束信息的蛋白定向進化平臺AiCE,實現對Cre蛋白多聚化界面的精準優化,獲得重組效率提升至3.5倍的工程化Cre蛋白變體。 最後,研究團隊創建並優化了重組酶的無痕編輯策略Re-pegRNA,利用引導編輯器的高效編輯特性,通過設計特異性pegRNA對重組後殘留的Lox位點進行「重引導編輯」,將其精準替換為原有基因組序列。 通過這三項技術的集成優化,研究團隊成功構建PCE與RePCE兩個可編程染色體編輯系統,可對不同Lox位點的插入位置和方向進行靈活編程,實現鹼基從千比特(kb)到兆比特(Mb)尺度的大片段DNA精準無痕操縱。 研究團隊表示,他們在動植物細胞中,利用新研發的系統已成功實現18.8 kb超大片段DNA的定點整合、5 kb序列的定向替換、12 Mb的染色體倒位、4 Mb的染色體刪除及整條染色體的易位。他們還利用新型大片段DNA精準操縱技術,成功創製含315 kb精準倒位的抗除草劑水稻種質,展示出其廣泛應用前景。 據了解,AiCE成果7月上旬已在線發表於《細胞》,並將與此次研究成果以背靠背形式於8月下旬在《細胞》紙質版正式刊出。(完)
杭州8月14日電(曹丹 孫琳茹)疏摘、清洗、裝袋……清晨4時採摘的杭州西湖荷葉與蓮蓬,僅用4個多小時便送達市民手中。 8月14日,工作人員在西湖北山街荷區採摘蓮蓬。王剛 攝 杭州西湖荷花久負盛名。接天蓮葉無窮碧,映日荷花別樣紅,南宋楊萬裡的詠荷詩傳誦至今。14日,一年一度的西湖荷葉蓮蓬愛心義賣活動在杭州西湖柳浪聞鶯舉行。今年的活動不僅延續了公益傳統,更首次融入健康養生內容,吸引眾多市民遊客熱情參與。 本次義賣推出的西湖「愛心蓮蓮套餐」包含3個蓮蓬和5張荷葉,每份售價10元。活動採取「先領號、後購買」的方式,每日7時發放當日限量號,8時30分憑票購買,售完即止。 西湖景區水域管理處黨政辦副主任沙姝慧介紹,西湖荷葉、荷花以觀賞為主,為確保下層荷花充分採光,採荷人每日4時便開始疏摘荷葉和蓮蓬,「今天發放了70個號,半小時內就被領完了。此次活動將持續至八月下旬,市民可以錯峰參與」。 8月14日,市民購買西湖荷葉、蓮蓬。王剛 攝 「我每年都會在活動第一天來購買。蓮子用來泡水喝,荷葉給孫子做荷葉雞,味道特別清香。」杭州老市民周昉說。 據介紹,今年的活動新增了中醫問診、八段錦教學和免費養生茶飲等項目。 桐君堂主任中醫師陳清江表示,夏季天氣炎熱,人們容易出現心火旺盛、食欲不振等症狀。「適量食用帶芯蓮子可清熱降火,改善睡眠。作為藥食同源的食材,蓮子可以煲湯、煮粥,既消暑又養生。」陳清江說。 8月14日,小朋友用買來的荷葉遮陽。王剛 攝 義賣現場,市民遊客有序排隊購買,拿到荷葉和蓮蓬後,便迫不及待地開始品嘗。現場還推出了「中醫冰粉」「荷葉烏梅茶」,進行限量義賣。 據悉,本次活動所得的全部善款將捐贈給慈善機構,讓每一份「荷」禮都化作雙份愛心,傳遞夏日溫情。(完)
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