北京8月4日電 (記者 孫自法)在生命科學領域,基因組編輯技術的迅速發展和廣泛應用,為基礎研究和應用開發提供強大的技術支撐。不過,大片段DNA(脫氧核糖核酸)編輯一直面臨重大挑戰,對數千乃至數百萬鹼基的精準操縱更是基因編輯領域的核心難題,備受關注。 育種和基因治療有巨大應用潛力 來自中國科學院遺傳與發育生物學研究所(遺傳發育所)的消息說,該所高彩霞研究員團隊最新研發出一種新型可編程的染色體編輯技術(Programmable Chromosome Engineering,PCE)。該技術在動植物中實現了從千鹼基到兆鹼基級別DNA的多類型染色體精準操縱,顯著提升了真核生物基因組的操縱尺度和能力。 利用大片段DNA精準操縱技術,研究人員不僅能實現多基因疊加編輯,還可通過操控基因組結構變異,為作物性狀改良和遺傳疾病治療開闢新路徑。同時,該技術有望推動新型育種策略的發展,例如通過操縱遺傳連鎖、調控重組頻率實現育性控制,以及消除連鎖累贅,充分釋放野生種質資源中優異等位基因的育種潛力。此外,精準染色體編輯技術的突破將加速人工染色體構建,在合成生物學等新興領域也有重要的應用前景。 本項研究PCE系統的開發和精準染色體編輯示意圖。中國科學院遺傳發育所 供圖 這項攻克大片段DNA精準編輯的重要成果論文,北京時間8月4日深夜在國際知名學術期刊《細胞》(Cell)上線發表。審稿人評價認為,中國團隊發表的研究工作,代表了基因工程領域的重大突破,在育種和基因治療方面具有巨大的應用潛力。 系統應用受到3個關鍵問題制約 論文通訊作者高彩霞研究員介紹說,以基因編輯工具CRISPR及其衍生技術為代表的編輯系統,通過可編程的嚮導RNA(核糖核酸)引導Cas9等核酸酶靶向基因組特定位點,已廣泛應用於特定鹼基和短片段DNA的精準編輯。但針對大片段DNA編輯,現有工具在編輯效率、尺度、精準性及類型多樣性等方面仍存在明顯不足。 研究團隊發現,位點特異性重組酶(Cre-Lox)系統具有染色體水平DNA操縱潛力,其原理是在基因組中引入Lox序列後,由Cre重組酶介導Lox位點之間的DNA重組來實現全基因組範圍內的遺傳操縱。 然而,Cre-Lox系統的應用受到3個關鍵問題的制約:Lox位點固有的對稱性導致重組反應可逆,不利於目的編輯的發生;Cre酶作為四聚體工作,提升其活性的工程改造難度高;重組後特異性位點殘留,影響編輯的精準性。 構建兩個可編程染色體編輯系統 高彩霞指出,為逐一突破上述限制,在本項研究中,研究團隊構建出系統性技術路徑:首先,開發高通量重組位點快速改造平臺,並提出不對稱Lox位點設計原則,成功創製新型Lox變體,保持高效重組效率的同時將可逆重組活性降低至陰性對照水平。 其次,基於研究團隊此前自主開發的融合蛋白通用逆摺疊模型、結構與進化約束信息的蛋白定向進化平臺AiCE,實現對Cre蛋白多聚化界面的精準優化,獲得重組效率提升至3.5倍的工程化Cre蛋白變體。 最後,研究團隊創建並優化了重組酶的無痕編輯策略Re-pegRNA,利用引導編輯器的高效編輯特性,通過設計特異性pegRNA對重組後殘留的Lox位點進行「重引導編輯」,將其精準替換為原有基因組序列。 通過這三項技術的集成優化,研究團隊成功構建PCE與RePCE兩個可編程染色體編輯系統,可對不同Lox位點的插入位置和方向進行靈活編程,實現鹼基從千比特(kb)到兆比特(Mb)尺度的大片段DNA精準無痕操縱。 研究團隊表示,他們在動植物細胞中,利用新研發的系統已成功實現18.8 kb超大片段DNA的定點整合、5 kb序列的定向替換、12 Mb的染色體倒位、4 Mb的染色體刪除及整條染色體的易位。他們還利用新型大片段DNA精準操縱技術,成功創製含315 kb精準倒位的抗除草劑水稻種質,展示出其廣泛應用前景。 據了解,AiCE成果7月上旬已在線發表於《細胞》,並將與此次研究成果以背靠背形式於8月下旬在《細胞》紙質版正式刊出。(完)
青海共和8月9日電 題:青海共和沙珠玉治沙記:黃沙變綠洲 記者 李江寧 站在青海共和縣沙珠玉治沙區遠望,一片綠色林帶牢牢守在龍羊峽水庫西北邊。這是「三北」工程多年治理的結果——樹木「鎖住」了移動的沙丘,耐旱植物紮根沙地,讓黃沙變綠洲。 「小時候聽爺爺說,這裡到處是流動沙丘,老百姓種地時,早上撒在地裡的種子,中午就被風吹走了。」今年48歲的趙雪彬是青海省治沙試驗站的副站長,也是第三代治沙人。講起沙珠玉地區的「前世今生」,趙雪彬兒時那些被風沙肆虐的記憶也再次浮現眼前。 二十世紀六七十年代,沙珠玉地區是黃河上遊風沙危害最嚴重的地區之一。這裡曾流傳著一句俗語:「在這裡種活一棵樹比養活一個孩子還要難。」彼時,沙珠玉既無「珠」更無「玉」。 圖為沙珠玉鄉治沙現場。薛蒂 攝 1958年,飽受風沙之苦的沙珠玉地區建立起共和縣防風治沙林場。1982年改制為青海省治沙試驗站,2000年後由青海省林業和草原局直屬管理。 建站之初,趙雪彬的祖父趙文軒與其餘6名建設者從全國各地奔赴沙珠玉地區,成為第一代治沙人。那時沒有機械,人背驢馱運樹苗。他們在這片沙土上摸索著育苗的法子,試驗著造林的技術。二十多年過去,終於在沙地上豎起了一道生態屏障。 「那時我在讀小學,爺爺會帶著我一起去治沙現場種樹,他有一根扁擔,挑著兩桶水,小心翼翼地給樹苗澆水,到了冬天,還會用沙土或草把育好的苗子蓋好越冬。」趙雪彬回憶道。 1979年,趙文軒的兒子趙士學接過了父親手中的接力棒,成了第二代治沙人,苦心鑽研沙珠玉的農田林網建設和治沙試驗。1997年,趙雪彬循著爺爺和父親的足跡,成了第三代治沙人。 圖為沙珠玉鄉治沙現場。薛蒂 攝 「從小看著爺爺和父親在這裡治沙,看著沙珠玉一點點的變化,我也想為這裡出份力,不讓祖輩和父輩的心血付諸東流。」趙雪彬說,爺爺和父親退休後,還會時不時來到沙珠玉探望,「『一座流動沙丘都沒有了,真好。』這是父親退休後來到沙珠玉地區時最常說的一句話。」 昔日的滾滾黃沙,今朝已化作連綿綠浪。當年種下的幼苗在沙海中倔強紮根,終成百裡林海。風沙收斂了脾氣——沙塵天氣越來越少,雨水也越來越眷顧這片土地。 「老一輩為治沙而治沙,而現在治沙不光要把沙治住,還要做好生物措施,讓它恢復到自然地生長的那種狀態。」趙雪彬說。 如今的沙珠玉,荒漠化土地面積11.7萬畝,佔全鄉總面積的數值從1956年的90.28%減至12.3%,實現了由「沙逼人退」到「綠進沙退」的根本性轉變,成為鑲嵌於青藏高原的「明珠美玉」。(完)
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