北京8月4日電 (記者 孫自法)在生命科學領域,基因組編輯技術的迅速發展和廣泛應用,為基礎研究和應用開發提供強大的技術支撐。不過,大片段DNA(脫氧核糖核酸)編輯一直面臨重大挑戰,對數千乃至數百萬鹼基的精準操縱更是基因編輯領域的核心難題,備受關注。 育種和基因治療有巨大應用潛力 來自中國科學院遺傳與發育生物學研究所(遺傳發育所)的消息說,該所高彩霞研究員團隊最新研發出一種新型可編程的染色體編輯技術(Programmable Chromosome Engineering,PCE)。該技術在動植物中實現了從千鹼基到兆鹼基級別DNA的多類型染色體精準操縱,顯著提升了真核生物基因組的操縱尺度和能力。 利用大片段DNA精準操縱技術,研究人員不僅能實現多基因疊加編輯,還可通過操控基因組結構變異,為作物性狀改良和遺傳疾病治療開闢新路徑。同時,該技術有望推動新型育種策略的發展,例如通過操縱遺傳連鎖、調控重組頻率實現育性控制,以及消除連鎖累贅,充分釋放野生種質資源中優異等位基因的育種潛力。此外,精準染色體編輯技術的突破將加速人工染色體構建,在合成生物學等新興領域也有重要的應用前景。 本項研究PCE系統的開發和精準染色體編輯示意圖。中國科學院遺傳發育所 供圖 這項攻克大片段DNA精準編輯的重要成果論文,北京時間8月4日深夜在國際知名學術期刊《細胞》(Cell)上線發表。審稿人評價認為,中國團隊發表的研究工作,代表了基因工程領域的重大突破,在育種和基因治療方面具有巨大的應用潛力。 系統應用受到3個關鍵問題制約 論文通訊作者高彩霞研究員介紹說,以基因編輯工具CRISPR及其衍生技術為代表的編輯系統,通過可編程的嚮導RNA(核糖核酸)引導Cas9等核酸酶靶向基因組特定位點,已廣泛應用於特定鹼基和短片段DNA的精準編輯。但針對大片段DNA編輯,現有工具在編輯效率、尺度、精準性及類型多樣性等方面仍存在明顯不足。 研究團隊發現,位點特異性重組酶(Cre-Lox)系統具有染色體水平DNA操縱潛力,其原理是在基因組中引入Lox序列後,由Cre重組酶介導Lox位點之間的DNA重組來實現全基因組範圍內的遺傳操縱。 然而,Cre-Lox系統的應用受到3個關鍵問題的制約:Lox位點固有的對稱性導致重組反應可逆,不利於目的編輯的發生;Cre酶作為四聚體工作,提升其活性的工程改造難度高;重組後特異性位點殘留,影響編輯的精準性。 構建兩個可編程染色體編輯系統 高彩霞指出,為逐一突破上述限制,在本項研究中,研究團隊構建出系統性技術路徑:首先,開發高通量重組位點快速改造平臺,並提出不對稱Lox位點設計原則,成功創製新型Lox變體,保持高效重組效率的同時將可逆重組活性降低至陰性對照水平。 其次,基於研究團隊此前自主開發的融合蛋白通用逆摺疊模型、結構與進化約束信息的蛋白定向進化平臺AiCE,實現對Cre蛋白多聚化界面的精準優化,獲得重組效率提升至3.5倍的工程化Cre蛋白變體。 最後,研究團隊創建並優化了重組酶的無痕編輯策略Re-pegRNA,利用引導編輯器的高效編輯特性,通過設計特異性pegRNA對重組後殘留的Lox位點進行「重引導編輯」,將其精準替換為原有基因組序列。 通過這三項技術的集成優化,研究團隊成功構建PCE與RePCE兩個可編程染色體編輯系統,可對不同Lox位點的插入位置和方向進行靈活編程,實現鹼基從千比特(kb)到兆比特(Mb)尺度的大片段DNA精準無痕操縱。 研究團隊表示,他們在動植物細胞中,利用新研發的系統已成功實現18.8 kb超大片段DNA的定點整合、5 kb序列的定向替換、12 Mb的染色體倒位、4 Mb的染色體刪除及整條染色體的易位。他們還利用新型大片段DNA精準操縱技術,成功創製含315 kb精準倒位的抗除草劑水稻種質,展示出其廣泛應用前景。 據了解,AiCE成果7月上旬已在線發表於《細胞》,並將與此次研究成果以背靠背形式於8月下旬在《細胞》紙質版正式刊出。(完)
蘭州8月9日電 (閆姣 王牧雨 九美旦增)洪水退去,淤泥深積,但山村的溫情卻從未被衝散。7日晚甘肅蘭州市榆中縣的罕見山洪摧毀了房屋,卻讓村民間的互助情誼愈發清晰——東家騰出床鋪安置鄰居,西家分享食物共渡難關,救援人員與村民並肩清淤重建家園。 「晚上11時左右,門縫裡的水突然湧進來,穿衣服的功夫,水就沒過床沿50釐米了。」回憶起7日晚的洪水,榆中縣興隆山村農家樂老闆王海雲仍心有餘悸。這場突如其來的災害,讓他經營多年的民宿毀於一旦,卻也讓他見證了危難中的守望相助。 記者9日在現場看到,洪水仍沿河道持續流淌,甘肅省級文物保護單位興隆山臥橋被衝毀;救援人員或背著受災民眾蹚過積水,或推著推車倒淤泥;通往受災較重的馬坡鄉的主幹道省道104正在緊張搶修中。 8月9日,甘肅蘭州市榆中縣山洪受災現場,消防人員展開救援。九美旦增 攝 山洪過後,王海雲暫住在鄉親家中。「村裡誰家有餘力,都會幫一把。東家給口吃的,西家騰張床鋪,都是常事。」他說,這種刻在骨子裡的互助,讓村民們在困境中多了份底氣。 8日一早,村民們便自發開始清理淤泥,各類救援力量陸續進村,大型清淤車輛也全天參與清理工作。王海雲看著救援人員用鐵鍬鏟、機械車推,一點點清理公路和房屋的淤泥,他說,路通了,物資才能進來,日子才能慢慢緩過來。 站在損毀的民宿前,王海雲望著正在作業的挖掘機,眼裡有惋惜,更有期盼:「等清完淤泥,總能一點點重建起來。」 8月9日,甘肅榆中縣,救援車輛開展河道清淤工作。九美旦增 攝 「目前村裡正組織家家戶戶開展清淤,明確各社分工。」興隆山村黨支部書記呂福紅介紹說。 榆中縣馬坡鄉的暴雨災情同樣嚴峻。「目前,部分村民已被安置在蘭州市七裡河區的酒店。」馬坡鄉舊莊溝村二社社長王名俊說,當時雖信號中斷,但村民們也都互相跑步傳話。從山洪發生至今他一直堅守崗位,帶領村民推進安置工作。 7日18時起,榆中縣遭短時強降雨天氣,引發山洪災害。災情發生後,甘肅省委、省政府第一時間開展救援搶險救災工作,組織應急、公安、交通、消防、電力、通信、醫療等部門投入救援人員、車輛機械、應急物資。 記者從甘肅省應急廳獲悉,截至9日18時,甘肅榆中縣等地山洪災害已造成15人遇難,28人失聯。失聯人員搜救、基礎設施搶修、民眾轉移安置等應急救援工作正在緊張有序進行。(完)
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