北京8月4日電 (記者 孫自法)在生命科學領域,基因組編輯技術的迅速發展和廣泛應用,為基礎研究和應用開發提供強大的技術支撐。不過,大片段DNA(脫氧核糖核酸)編輯一直面臨重大挑戰,對數千乃至數百萬鹼基的精準操縱更是基因編輯領域的核心難題,備受關注。 育種和基因治療有巨大應用潛力 來自中國科學院遺傳與發育生物學研究所(遺傳發育所)的消息說,該所高彩霞研究員團隊最新研發出一種新型可編程的染色體編輯技術(Programmable Chromosome Engineering,PCE)。該技術在動植物中實現了從千鹼基到兆鹼基級別DNA的多類型染色體精準操縱,顯著提升了真核生物基因組的操縱尺度和能力。 利用大片段DNA精準操縱技術,研究人員不僅能實現多基因疊加編輯,還可通過操控基因組結構變異,為作物性狀改良和遺傳疾病治療開闢新路徑。同時,該技術有望推動新型育種策略的發展,例如通過操縱遺傳連鎖、調控重組頻率實現育性控制,以及消除連鎖累贅,充分釋放野生種質資源中優異等位基因的育種潛力。此外,精準染色體編輯技術的突破將加速人工染色體構建,在合成生物學等新興領域也有重要的應用前景。 本項研究PCE系統的開發和精準染色體編輯示意圖。中國科學院遺傳發育所 供圖 這項攻克大片段DNA精準編輯的重要成果論文,北京時間8月4日深夜在國際知名學術期刊《細胞》(Cell)上線發表。審稿人評價認為,中國團隊發表的研究工作,代表了基因工程領域的重大突破,在育種和基因治療方面具有巨大的應用潛力。 系統應用受到3個關鍵問題制約 論文通訊作者高彩霞研究員介紹說,以基因編輯工具CRISPR及其衍生技術為代表的編輯系統,通過可編程的嚮導RNA(核糖核酸)引導Cas9等核酸酶靶向基因組特定位點,已廣泛應用於特定鹼基和短片段DNA的精準編輯。但針對大片段DNA編輯,現有工具在編輯效率、尺度、精準性及類型多樣性等方面仍存在明顯不足。 研究團隊發現,位點特異性重組酶(Cre-Lox)系統具有染色體水平DNA操縱潛力,其原理是在基因組中引入Lox序列後,由Cre重組酶介導Lox位點之間的DNA重組來實現全基因組範圍內的遺傳操縱。 然而,Cre-Lox系統的應用受到3個關鍵問題的制約:Lox位點固有的對稱性導致重組反應可逆,不利於目的編輯的發生;Cre酶作為四聚體工作,提升其活性的工程改造難度高;重組後特異性位點殘留,影響編輯的精準性。 構建兩個可編程染色體編輯系統 高彩霞指出,為逐一突破上述限制,在本項研究中,研究團隊構建出系統性技術路徑:首先,開發高通量重組位點快速改造平臺,並提出不對稱Lox位點設計原則,成功創製新型Lox變體,保持高效重組效率的同時將可逆重組活性降低至陰性對照水平。 其次,基於研究團隊此前自主開發的融合蛋白通用逆摺疊模型、結構與進化約束信息的蛋白定向進化平臺AiCE,實現對Cre蛋白多聚化界面的精準優化,獲得重組效率提升至3.5倍的工程化Cre蛋白變體。 最後,研究團隊創建並優化了重組酶的無痕編輯策略Re-pegRNA,利用引導編輯器的高效編輯特性,通過設計特異性pegRNA對重組後殘留的Lox位點進行「重引導編輯」,將其精準替換為原有基因組序列。 通過這三項技術的集成優化,研究團隊成功構建PCE與RePCE兩個可編程染色體編輯系統,可對不同Lox位點的插入位置和方向進行靈活編程,實現鹼基從千比特(kb)到兆比特(Mb)尺度的大片段DNA精準無痕操縱。 研究團隊表示,他們在動植物細胞中,利用新研發的系統已成功實現18.8 kb超大片段DNA的定點整合、5 kb序列的定向替換、12 Mb的染色體倒位、4 Mb的染色體刪除及整條染色體的易位。他們還利用新型大片段DNA精準操縱技術,成功創製含315 kb精準倒位的抗除草劑水稻種質,展示出其廣泛應用前景。 據了解,AiCE成果7月上旬已在線發表於《細胞》,並將與此次研究成果以背靠背形式於8月下旬在《細胞》紙質版正式刊出。(完)
如何以「遊戲+科普」模式,傳遞雨林保護理念?近日,樂元素旗下休閒遊戲《開心消消樂》發起了 「去雨林!朋友!」公益活動,激發公眾對生態保護的情感共鳴與行動意識。在遊戲中,玩家通過升級雨林棲息地、完成組隊任務、解鎖分享生態圖鑑,不僅獲得了遊戲樂趣,更理解了熱帶雨林的垂直分層、生物多樣性與生態共生關係。遊戲餘熱未消,一場沉浸式、可參與、可感知的科普化學習場景拉開帷幕。8月初,一支由青少年和家長們組成的「雨林小分隊」,走進了海南熱帶雨林國家公園,感受大自然的獨特魅力。在雨林課堂中,他們跟隨專業老師領略了空中花園、獨木成林等自然奇觀。「老師說這棵樹有4700歲,真的不敢相信。」在百花嶺,11歲的上海女孩陳秋見到了傳說中的「神樹」,她驚訝地瞪圓了眼睛。「最神奇的是樹上垂下來的綠蘿,跟我家陽臺上的完全不一樣。熱帶雨林裡的植物比我想像的更勇敢,它們不用花盆也能長大,還能陪著一棵古樹活了幾千年。」夜探雨林的活動亦是驚喜不斷,大燕蛾、鋸腿原指樹蛙等多種珍稀動物一一亮相,讓城市裡的孩子們大開眼界。在參觀的同時,孩子們要完成自然標本,繪製觀察筆記,記錄下這趟難忘旅程中的點點滴滴。「孩子邊做自然標本邊念叨遊戲裡的生態知識,還拉著同齡小朋友討論桌遊策略,晚上和大家一起圍坐分享。每個孩子都有自己的『雨林發現』,這種互動比悶頭旅遊有意義多了。」作為陪玩家長的劉蒙,原本只想著「換個地方帶娃」,結果卻有意外驚喜。家長和孩子們紛紛表示,之前在遊戲裡積極分享生態圖鑑,此次遊學活動則在線下「開了眼」;聆聽專業帶隊老師生動有趣的科普講解,更是受益良多。活動期間,大家圍繞以熱帶雨林保護為主題的國家公園桌遊《雨林奇境》,展開交流切磋,營造出「以遊會友、以學促知」的互動氛圍,使雨林保護理念在輕鬆愉快的交流中得以進一步傳遞。該桌遊由上海科技館出品,是2025年「我們的國家公園」科學桌遊挑戰活動的官方指定桌遊。一直以來,《開心消消樂》致力於通過遊戲場景傳遞正向價值,與上海科技館、上海自然博物館等進行了多次深度聯動,積累了豐富的科普傳播經驗。上海科技館館方表示:「樂元素用技術與創意連接了遊戲世界與自然世界的橋梁,是上海科技館在傳播自然保護理念、助力可持續發展目標實踐中的重要合作夥伴。」「遊戲賦能科普優勢很明顯。遊戲具有強參與感和沉浸感,用戶在升級棲息地、解鎖圖鑑等創新方式裡邊學邊玩,從而對公益內容產生特殊的感情,這種情感羈絆會延伸到現實,喚起公眾對自然保護的意識。藉助遊戲這個『科普放大器』,可以讓科普影響更持久。」樂元素公益負責人李雅說,「一系列公益活動發揮遊戲寓教於樂的社會功能,能讓科學知識走出展廳,也讓科學保護的理念通過遊戲的溫度,傳遞給更多人。」未來,樂元素期待與更多機構深化合作,以科學教育與數字文化的深度融合為抓手,推動全民科普邁入更多元、更多樣、更具參與感的新時代,也為遊戲行業履行社會責任、實現社會價值提供可推廣的優秀範例。
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