北京8月4日電 (記者 孫自法)在生命科學領域,基因組編輯技術的迅速發展和廣泛應用,為基礎研究和應用開發提供強大的技術支撐。不過,大片段DNA(脫氧核糖核酸)編輯一直面臨重大挑戰,對數千乃至數百萬鹼基的精準操縱更是基因編輯領域的核心難題,備受關注。 育種和基因治療有巨大應用潛力 來自中國科學院遺傳與發育生物學研究所(遺傳發育所)的消息說,該所高彩霞研究員團隊最新研發出一種新型可編程的染色體編輯技術(Programmable Chromosome Engineering,PCE)。該技術在動植物中實現了從千鹼基到兆鹼基級別DNA的多類型染色體精準操縱,顯著提升了真核生物基因組的操縱尺度和能力。 利用大片段DNA精準操縱技術,研究人員不僅能實現多基因疊加編輯,還可通過操控基因組結構變異,為作物性狀改良和遺傳疾病治療開闢新路徑。同時,該技術有望推動新型育種策略的發展,例如通過操縱遺傳連鎖、調控重組頻率實現育性控制,以及消除連鎖累贅,充分釋放野生種質資源中優異等位基因的育種潛力。此外,精準染色體編輯技術的突破將加速人工染色體構建,在合成生物學等新興領域也有重要的應用前景。 本項研究PCE系統的開發和精準染色體編輯示意圖。中國科學院遺傳發育所 供圖 這項攻克大片段DNA精準編輯的重要成果論文,北京時間8月4日深夜在國際知名學術期刊《細胞》(Cell)上線發表。審稿人評價認為,中國團隊發表的研究工作,代表了基因工程領域的重大突破,在育種和基因治療方面具有巨大的應用潛力。 系統應用受到3個關鍵問題制約 論文通訊作者高彩霞研究員介紹說,以基因編輯工具CRISPR及其衍生技術為代表的編輯系統,通過可編程的嚮導RNA(核糖核酸)引導Cas9等核酸酶靶向基因組特定位點,已廣泛應用於特定鹼基和短片段DNA的精準編輯。但針對大片段DNA編輯,現有工具在編輯效率、尺度、精準性及類型多樣性等方面仍存在明顯不足。 研究團隊發現,位點特異性重組酶(Cre-Lox)系統具有染色體水平DNA操縱潛力,其原理是在基因組中引入Lox序列後,由Cre重組酶介導Lox位點之間的DNA重組來實現全基因組範圍內的遺傳操縱。 然而,Cre-Lox系統的應用受到3個關鍵問題的制約:Lox位點固有的對稱性導致重組反應可逆,不利於目的編輯的發生;Cre酶作為四聚體工作,提升其活性的工程改造難度高;重組後特異性位點殘留,影響編輯的精準性。 構建兩個可編程染色體編輯系統 高彩霞指出,為逐一突破上述限制,在本項研究中,研究團隊構建出系統性技術路徑:首先,開發高通量重組位點快速改造平臺,並提出不對稱Lox位點設計原則,成功創製新型Lox變體,保持高效重組效率的同時將可逆重組活性降低至陰性對照水平。 其次,基於研究團隊此前自主開發的融合蛋白通用逆摺疊模型、結構與進化約束信息的蛋白定向進化平臺AiCE,實現對Cre蛋白多聚化界面的精準優化,獲得重組效率提升至3.5倍的工程化Cre蛋白變體。 最後,研究團隊創建並優化了重組酶的無痕編輯策略Re-pegRNA,利用引導編輯器的高效編輯特性,通過設計特異性pegRNA對重組後殘留的Lox位點進行「重引導編輯」,將其精準替換為原有基因組序列。 通過這三項技術的集成優化,研究團隊成功構建PCE與RePCE兩個可編程染色體編輯系統,可對不同Lox位點的插入位置和方向進行靈活編程,實現鹼基從千比特(kb)到兆比特(Mb)尺度的大片段DNA精準無痕操縱。 研究團隊表示,他們在動植物細胞中,利用新研發的系統已成功實現18.8 kb超大片段DNA的定點整合、5 kb序列的定向替換、12 Mb的染色體倒位、4 Mb的染色體刪除及整條染色體的易位。他們還利用新型大片段DNA精準操縱技術,成功創製含315 kb精準倒位的抗除草劑水稻種質,展示出其廣泛應用前景。 據了解,AiCE成果7月上旬已在線發表於《細胞》,並將與此次研究成果以背靠背形式於8月下旬在《細胞》紙質版正式刊出。(完)
在漕寶路上的徐匯日月光中心門前,中午尖峰時段的外賣騎手停車峰值高達上千輛次。再加上還有市民上班、購物、在此換乘軌交12號線等各種需求,因此,自從徐匯日月光開業以來,門前的非機動車總是停得滿滿當當,不僅擠滿了約三米寬的人行道,導致行人與非機動車搶道,還經常蔓延到非機動車道上。這個曾幾經治理仍無法根治的老大難問題兩次上過「區長熱線」,最近,記者來到這裡發現,經過最新一輪綜合治理,徐匯日月光周邊非機動車停車秩序煥然一新,街區面貌也更整齊敞亮,讓來這裡購物的消費者也更有好心情了。 改造前原貌。早在2020年夏季,就有市民向「夏令熱線·區長訪談」反映,在日月光中心門口,東起漕溪路、西至蒲匯塘橋的漕寶路北側近300米的人行道長期被電動自行車佔據,居民步行不便,推嬰兒車等經過更是艱難,存在安全隱患。幾年來,徐匯區建管委、區交通中心、田林街道等相關部門多次進行綜合治理,並與日月光協商退讓紅線內部分面積,調整臺階及綠化布局,將人行道步行空間由原來的3米多拓寬至4米多,為非機動車停車騰挪出一片空間。同時,協調轄區交警對交通違法現象予以整治,並委託第三方管理公司定期巡查和管理。 改造前。然而,由於停車區域面積仍有限,且部分區域距離非機動車道較遠,因此,一些市民和外賣騎手在指定區域內規範停車意願不強,仍圖方便將車擠在人行道和非機動車道上。特別是,消費習慣的變化和平臺補貼大戰催生外賣需求越來越大,使得每天11時到13時的尖峰時段外賣車輛總數高達上千輛次,仍有大量非機動車擁擠在人行通道和非機動車道上。市民對此意見紛紛,12345市民熱線月均接到七八起相關反映。今年初,田林街道會同區建委、區綠化市容局、區交警支隊、區市政中心、區交通中心、日月光等單位,打出了新一輪「組合拳」。 商場北側開通一條便道釋放車位、分流車輛。孫雲攝(下同)首先,擴大「蓄水池」——經過與日月光協商,在其紅線範圍內進一步挖掘空間,在商場東西兩側同時增設非機動車停車場,增加車位158個,其中88個為外賣騎手專用;其次,聯動周邊資源,與相鄰的匯騰廣場協商,結合「美麗街區」建設,對其廣場實施改造,新增約60個非機動車停車位;並打通日月光與北側漕溪路258弄保租房地塊的通道,既方便住戶往返日月光,也增加了幾十個外賣騎手專用停車位,分流了部分騎手從日月光北側進出取餐,基本杜絕了漕寶路欽州路路口外賣非機動車逆行問題;同時,與區交警支隊、區交通中心、區市政中心對接,調整日月光的機動車進出動線,並優化進口通道寬度,進一步緩解了交通擁堵,避免人車混行和機非混行,還進一步釋放了非機動車停放空間。整治後寬敞整齊的人行道。7月底,相關改建工程陸續完工,田林街道一方面安排人員疏導管理,一方面與轄區外賣配送站點溝通宣講,讓騎手養成在專用停車位停車習慣。昨天中午,記者在現場看到,10分鐘裡,除了有兩三個騎手圖方便仍將車停在非機動車道上,其餘都自覺停進了騎手專用區,人行道和商場周邊秩序井然,看得舒心,走得也安心,難怪半個月來,12345市民熱線再也沒有接到過相關投訴。街道工作人員還告訴記者,下一步,計劃在漕溪路258弄保租房片區內建設「小哥驛站」,分流騎手進出和停放的同時,也為小哥們提供休息、飲水、充電等服務,讓商圈既有「風度」又有「溫度」。
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