北京8月4日電 (記者 孫自法)在生命科學領域,基因組編輯技術的迅速發展和廣泛應用,為基礎研究和應用開發提供強大的技術支撐。不過,大片段DNA(脫氧核糖核酸)編輯一直面臨重大挑戰,對數千乃至數百萬鹼基的精準操縱更是基因編輯領域的核心難題,備受關注。 育種和基因治療有巨大應用潛力 來自中國科學院遺傳與發育生物學研究所(遺傳發育所)的消息說,該所高彩霞研究員團隊最新研發出一種新型可編程的染色體編輯技術(Programmable Chromosome Engineering,PCE)。該技術在動植物中實現了從千鹼基到兆鹼基級別DNA的多類型染色體精準操縱,顯著提升了真核生物基因組的操縱尺度和能力。 利用大片段DNA精準操縱技術,研究人員不僅能實現多基因疊加編輯,還可通過操控基因組結構變異,為作物性狀改良和遺傳疾病治療開闢新路徑。同時,該技術有望推動新型育種策略的發展,例如通過操縱遺傳連鎖、調控重組頻率實現育性控制,以及消除連鎖累贅,充分釋放野生種質資源中優異等位基因的育種潛力。此外,精準染色體編輯技術的突破將加速人工染色體構建,在合成生物學等新興領域也有重要的應用前景。 本項研究PCE系統的開發和精準染色體編輯示意圖。中國科學院遺傳發育所 供圖 這項攻克大片段DNA精準編輯的重要成果論文,北京時間8月4日深夜在國際知名學術期刊《細胞》(Cell)上線發表。審稿人評價認為,中國團隊發表的研究工作,代表了基因工程領域的重大突破,在育種和基因治療方面具有巨大的應用潛力。 系統應用受到3個關鍵問題制約 論文通訊作者高彩霞研究員介紹說,以基因編輯工具CRISPR及其衍生技術為代表的編輯系統,通過可編程的嚮導RNA(核糖核酸)引導Cas9等核酸酶靶向基因組特定位點,已廣泛應用於特定鹼基和短片段DNA的精準編輯。但針對大片段DNA編輯,現有工具在編輯效率、尺度、精準性及類型多樣性等方面仍存在明顯不足。 研究團隊發現,位點特異性重組酶(Cre-Lox)系統具有染色體水平DNA操縱潛力,其原理是在基因組中引入Lox序列後,由Cre重組酶介導Lox位點之間的DNA重組來實現全基因組範圍內的遺傳操縱。 然而,Cre-Lox系統的應用受到3個關鍵問題的制約:Lox位點固有的對稱性導致重組反應可逆,不利於目的編輯的發生;Cre酶作為四聚體工作,提升其活性的工程改造難度高;重組後特異性位點殘留,影響編輯的精準性。 構建兩個可編程染色體編輯系統 高彩霞指出,為逐一突破上述限制,在本項研究中,研究團隊構建出系統性技術路徑:首先,開發高通量重組位點快速改造平臺,並提出不對稱Lox位點設計原則,成功創製新型Lox變體,保持高效重組效率的同時將可逆重組活性降低至陰性對照水平。 其次,基於研究團隊此前自主開發的融合蛋白通用逆摺疊模型、結構與進化約束信息的蛋白定向進化平臺AiCE,實現對Cre蛋白多聚化界面的精準優化,獲得重組效率提升至3.5倍的工程化Cre蛋白變體。 最後,研究團隊創建並優化了重組酶的無痕編輯策略Re-pegRNA,利用引導編輯器的高效編輯特性,通過設計特異性pegRNA對重組後殘留的Lox位點進行「重引導編輯」,將其精準替換為原有基因組序列。 通過這三項技術的集成優化,研究團隊成功構建PCE與RePCE兩個可編程染色體編輯系統,可對不同Lox位點的插入位置和方向進行靈活編程,實現鹼基從千比特(kb)到兆比特(Mb)尺度的大片段DNA精準無痕操縱。 研究團隊表示,他們在動植物細胞中,利用新研發的系統已成功實現18.8 kb超大片段DNA的定點整合、5 kb序列的定向替換、12 Mb的染色體倒位、4 Mb的染色體刪除及整條染色體的易位。他們還利用新型大片段DNA精準操縱技術,成功創製含315 kb精準倒位的抗除草劑水稻種質,展示出其廣泛應用前景。 據了解,AiCE成果7月上旬已在線發表於《細胞》,並將與此次研究成果以背靠背形式於8月下旬在《細胞》紙質版正式刊出。(完)
寧波8月12日電 (張益聰)「面對當前心血管疾病防治的嚴峻態勢,我們將探索心血管疾病預防、篩查、幹預的『一鍵式』管理監測機制。」11日,浙江省寧波市動脈粥樣硬化性心血管疾病(下稱:ASCVD)智能防控平臺啟動會現場,寧波市心血管病防治臨床指導中心主任、寧波大學附屬第一醫院(下稱:寧大一院)首席專家、心臟中心主任陳曉敏如是說。 如其所言,《中國心血管健康與疾病報告2023》數據顯示,中國心血管病現患人數高達3.3億,且呈現年輕化、多病共存趨勢。 會議現場。張益聰 攝 智能防控:三大優勢精管「三高一重」 「在心血管疾病中,高血壓、高血糖、高血脂、肥胖被稱為『三高一重』,是ASCVD的主要病因。」寧波市衛生健康委員會黨委委員、副主任史國建表示,寧波作為人口流入大市,積極創新智能化防控手段,有助於當地有效應對人口老齡化帶來的「三高一重」人群擴大所帶來的一系列挑戰。 為此,寧波市ASCVD智能防控平臺由寧波市心血管疾病防治臨床指導中心聯合多學科團隊,依託市級重大項目孵化而成,是寧波市首個心血管疾病智慧防控平臺。對ASCVD高危人群,尤其是對以「三高一重」為核心風險因素人群的精準識別、分層與幹預管理。 「目前,在已掌握數據中,寧波市心血管疾病中高危以上人數突破300萬,其中以ASCVD為主。」陳曉敏表示,為高效應對大基數患者人群,本次ASCVD智能防控平臺有三大核心優勢,一是風險預警智能化,精準識別高危;二是診療決策同質化,規範管理路徑;三是管理模式閉環化,全程數字追蹤。 具體而言,上述平臺在「篩查—分層—幹預」全流程的數位化閉環管理基礎上,還擁有「超高危—極高危—中高危」三級彈窗預警機制,並據此為不同風險等級人群智能生成個性化幹預目標。 ASCVD智能防控平臺試點的應用現場。主辦方 供圖 惠民實效:一鍵診療一域「心病無憂」 走進寧海縣ASCVD智能防控平臺試點,隨著病患就診信息錄入診室電腦,坐診醫生通過大數據模型一鍵對患者進行病情風險分級,並將本次就診信息同步至寧波市衛生信息中心,再將信息回流至各大基層醫院,實現「一鍵診療,全域共享」。 在陳曉敏看來,目前上述平臺在ASCVD預防和篩查方面的智能化技術較為成熟,將有助於寧波市在「慢病一體化」格局下,實施醫療衛生領域縱深心血管疾病的民生工程。 「接下來,隨著平臺的更新迭代,基層醫生還能一鍵獲取由三甲醫院專家制定的規範化藥物聯用建議、科學轉診指徵及個體化隨訪計劃。」陳曉敏接續前言,該平臺不僅以ASCVD防治關口前移為目標,還將逐步探索多學科幹預和治療的心病防治「後半程」。 截至目前,上述平臺依託寧波市醫療大數據平臺,已經著重對「三高一重」相關核心指標的達標率、用藥依從性等進行動態監測與評估,為優化個體及群體的管理策略提供強有力數據支撐。 此外,在試點階段,寧波市ASCVD智能防控平臺將建立覆蓋寧海縣、北侖區全域及江北區部分醫院的防控網絡。後續,該平臺還會將成熟的「一鍵式」智能診療技術集成至醫療智能體,進而將醫療惠民的科技資源,延伸至基層醫療的「最後一公裡」。(完)
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