北京8月4日電 (記者 孫自法)在生命科學領域,基因組編輯技術的迅速發展和廣泛應用,為基礎研究和應用開發提供強大的技術支撐。不過,大片段DNA(脫氧核糖核酸)編輯一直面臨重大挑戰,對數千乃至數百萬鹼基的精準操縱更是基因編輯領域的核心難題,備受關注。 育種和基因治療有巨大應用潛力 來自中國科學院遺傳與發育生物學研究所(遺傳發育所)的消息說,該所高彩霞研究員團隊最新研發出一種新型可編程的染色體編輯技術(Programmable Chromosome Engineering,PCE)。該技術在動植物中實現了從千鹼基到兆鹼基級別DNA的多類型染色體精準操縱,顯著提升了真核生物基因組的操縱尺度和能力。 利用大片段DNA精準操縱技術,研究人員不僅能實現多基因疊加編輯,還可通過操控基因組結構變異,為作物性狀改良和遺傳疾病治療開闢新路徑。同時,該技術有望推動新型育種策略的發展,例如通過操縱遺傳連鎖、調控重組頻率實現育性控制,以及消除連鎖累贅,充分釋放野生種質資源中優異等位基因的育種潛力。此外,精準染色體編輯技術的突破將加速人工染色體構建,在合成生物學等新興領域也有重要的應用前景。 本項研究PCE系統的開發和精準染色體編輯示意圖。中國科學院遺傳發育所 供圖 這項攻克大片段DNA精準編輯的重要成果論文,北京時間8月4日深夜在國際知名學術期刊《細胞》(Cell)上線發表。審稿人評價認為,中國團隊發表的研究工作,代表了基因工程領域的重大突破,在育種和基因治療方面具有巨大的應用潛力。 系統應用受到3個關鍵問題制約 論文通訊作者高彩霞研究員介紹說,以基因編輯工具CRISPR及其衍生技術為代表的編輯系統,通過可編程的嚮導RNA(核糖核酸)引導Cas9等核酸酶靶向基因組特定位點,已廣泛應用於特定鹼基和短片段DNA的精準編輯。但針對大片段DNA編輯,現有工具在編輯效率、尺度、精準性及類型多樣性等方面仍存在明顯不足。 研究團隊發現,位點特異性重組酶(Cre-Lox)系統具有染色體水平DNA操縱潛力,其原理是在基因組中引入Lox序列後,由Cre重組酶介導Lox位點之間的DNA重組來實現全基因組範圍內的遺傳操縱。 然而,Cre-Lox系統的應用受到3個關鍵問題的制約:Lox位點固有的對稱性導致重組反應可逆,不利於目的編輯的發生;Cre酶作為四聚體工作,提升其活性的工程改造難度高;重組後特異性位點殘留,影響編輯的精準性。 構建兩個可編程染色體編輯系統 高彩霞指出,為逐一突破上述限制,在本項研究中,研究團隊構建出系統性技術路徑:首先,開發高通量重組位點快速改造平臺,並提出不對稱Lox位點設計原則,成功創製新型Lox變體,保持高效重組效率的同時將可逆重組活性降低至陰性對照水平。 其次,基於研究團隊此前自主開發的融合蛋白通用逆摺疊模型、結構與進化約束信息的蛋白定向進化平臺AiCE,實現對Cre蛋白多聚化界面的精準優化,獲得重組效率提升至3.5倍的工程化Cre蛋白變體。 最後,研究團隊創建並優化了重組酶的無痕編輯策略Re-pegRNA,利用引導編輯器的高效編輯特性,通過設計特異性pegRNA對重組後殘留的Lox位點進行「重引導編輯」,將其精準替換為原有基因組序列。 通過這三項技術的集成優化,研究團隊成功構建PCE與RePCE兩個可編程染色體編輯系統,可對不同Lox位點的插入位置和方向進行靈活編程,實現鹼基從千比特(kb)到兆比特(Mb)尺度的大片段DNA精準無痕操縱。 研究團隊表示,他們在動植物細胞中,利用新研發的系統已成功實現18.8 kb超大片段DNA的定點整合、5 kb序列的定向替換、12 Mb的染色體倒位、4 Mb的染色體刪除及整條染色體的易位。他們還利用新型大片段DNA精準操縱技術,成功創製含315 kb精準倒位的抗除草劑水稻種質,展示出其廣泛應用前景。 據了解,AiCE成果7月上旬已在線發表於《細胞》,並將與此次研究成果以背靠背形式於8月下旬在《細胞》紙質版正式刊出。(完)
原標題:傾倒煤矸石的耕地已恢復(反饋) 人民日報 本報記者 史一棋 金 歆 5月12日,本報「讀者來信」版刊登煤渣傾倒耕地 多年難以恢復(來信調查),報導河南洛陽市新安縣一企業在耕地裡隨意傾倒煤矸石,多年沒有處理的問題。 報導刊發後,洛陽市委市政府、新安縣委縣政府迅速行動,組織相關部門成立聯合工作組進行核查。 經調查,涉事企業為義煤集團新義礦業有限公司(以下簡稱「新義礦業」)。2011年起,新義礦業分別與河南賽祺道路運輸有限公司、新安縣崗南商貿有限公司、河南義新物流科技有限公司3家公司籤訂煤矸石處理協議。3家公司與村民協商約定補償標準後,選取周邊村莊溝壑、低地等處理煤矸石。煤矸石佔壓地塊共12處、341.51畝,涉及新安縣正村鎮白牆村、上坡村、西白村、十萬村、太平村。佔壓時地類性質為耕地的142.12畝、林地77.65畝、其他未利用地121.74畝。 關於煤矸石造成環境汙染問題,土壤環境方面,洛陽嘉清檢測技術有限公司對佔壓地塊的土壤進行取樣監測,全面調查分析涉及地塊的土壤狀況,報告顯示監測結果均在正常範圍內。 地下水環境方面,開鑿30眼地下水監測井,5月29日至6月5日,取樣監測3批42個樣品,檢測結果顯示符合農業用水要求。 關於耕地復墾問題,5月12日以來,由正村鎮政府負責,督促企業落實土地復墾主體責任。針對群眾反映復墾質量不高、部分地塊復墾后土層薄、耕種不便的問題,逐地塊進行實地踏勘,充分徵求群眾意見,按照覆土厚度不低於60釐米的標準,對涉及地塊進行了覆土作業,截至5月25日已全部完成覆土。5月26日至27日,市縣相關負責同志經過實地調研、組織涉及群眾代表座談,對目前整改成果表示認同,群眾代表對此次覆土表示滿意。 關於4處違法佔地建設問題,新安縣委縣政府責成正村鎮政府和縣自然資源局立即啟動立案查處程序,依法依規進行處罰。其中,個人違法的2起案件已由正村鎮政府立案,1起辦理完畢、罰款已繳納,1起涉及違法犯罪線索已按程序移交公安部門;村集體違法的2起案件已由縣自然資源局立案,責令其退還非法佔用土地、限期拆除復耕,目前已完成拆除復耕。針對新義礦業2011年至2018年期間委託無資質的第三方公司非法處置煤矸石的行為,根據固體廢物汙染環境防治法,由洛陽市生態環境局新安分局對其進行立案處罰,共計罰款31.75萬元。 此外,新安縣紀委監委成立調查組,對相關職能部門和有關人員失職失責問題進行調查核實。經縣紀委常委會研究決定,給予黨紀政務處分13人、組織處理5人。按照黨員組織關係,三門峽市盧氏縣紀委監委給予黨紀政務處分1人。 新安縣委縣政府負責人表示,將舉一反三,在全縣範圍內加強警示教育,做實以案促改、以案促治,紮實開展違法違規佔用耕地林地問題「百日攻堅」專項行動、生態環境保護重點工作「百日攻堅」專項行動,發現問題逐一落實整改措施、整改時限,切實把作風硬要求變成硬措施,確保問題整改到位。
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