北京8月4日電 (記者 孫自法)在生命科學領域,基因組編輯技術的迅速發展和廣泛應用,為基礎研究和應用開發提供強大的技術支撐。不過,大片段DNA(脫氧核糖核酸)編輯一直面臨重大挑戰,對數千乃至數百萬鹼基的精準操縱更是基因編輯領域的核心難題,備受關注。 育種和基因治療有巨大應用潛力 來自中國科學院遺傳與發育生物學研究所(遺傳發育所)的消息說,該所高彩霞研究員團隊最新研發出一種新型可編程的染色體編輯技術(Programmable Chromosome Engineering,PCE)。該技術在動植物中實現了從千鹼基到兆鹼基級別DNA的多類型染色體精準操縱,顯著提升了真核生物基因組的操縱尺度和能力。 利用大片段DNA精準操縱技術,研究人員不僅能實現多基因疊加編輯,還可通過操控基因組結構變異,為作物性狀改良和遺傳疾病治療開闢新路徑。同時,該技術有望推動新型育種策略的發展,例如通過操縱遺傳連鎖、調控重組頻率實現育性控制,以及消除連鎖累贅,充分釋放野生種質資源中優異等位基因的育種潛力。此外,精準染色體編輯技術的突破將加速人工染色體構建,在合成生物學等新興領域也有重要的應用前景。 本項研究PCE系統的開發和精準染色體編輯示意圖。中國科學院遺傳發育所 供圖 這項攻克大片段DNA精準編輯的重要成果論文,北京時間8月4日深夜在國際知名學術期刊《細胞》(Cell)上線發表。審稿人評價認為,中國團隊發表的研究工作,代表了基因工程領域的重大突破,在育種和基因治療方面具有巨大的應用潛力。 系統應用受到3個關鍵問題制約 論文通訊作者高彩霞研究員介紹說,以基因編輯工具CRISPR及其衍生技術為代表的編輯系統,通過可編程的嚮導RNA(核糖核酸)引導Cas9等核酸酶靶向基因組特定位點,已廣泛應用於特定鹼基和短片段DNA的精準編輯。但針對大片段DNA編輯,現有工具在編輯效率、尺度、精準性及類型多樣性等方面仍存在明顯不足。 研究團隊發現,位點特異性重組酶(Cre-Lox)系統具有染色體水平DNA操縱潛力,其原理是在基因組中引入Lox序列後,由Cre重組酶介導Lox位點之間的DNA重組來實現全基因組範圍內的遺傳操縱。 然而,Cre-Lox系統的應用受到3個關鍵問題的制約:Lox位點固有的對稱性導致重組反應可逆,不利於目的編輯的發生;Cre酶作為四聚體工作,提升其活性的工程改造難度高;重組後特異性位點殘留,影響編輯的精準性。 構建兩個可編程染色體編輯系統 高彩霞指出,為逐一突破上述限制,在本項研究中,研究團隊構建出系統性技術路徑:首先,開發高通量重組位點快速改造平臺,並提出不對稱Lox位點設計原則,成功創製新型Lox變體,保持高效重組效率的同時將可逆重組活性降低至陰性對照水平。 其次,基於研究團隊此前自主開發的融合蛋白通用逆摺疊模型、結構與進化約束信息的蛋白定向進化平臺AiCE,實現對Cre蛋白多聚化界面的精準優化,獲得重組效率提升至3.5倍的工程化Cre蛋白變體。 最後,研究團隊創建並優化了重組酶的無痕編輯策略Re-pegRNA,利用引導編輯器的高效編輯特性,通過設計特異性pegRNA對重組後殘留的Lox位點進行「重引導編輯」,將其精準替換為原有基因組序列。 通過這三項技術的集成優化,研究團隊成功構建PCE與RePCE兩個可編程染色體編輯系統,可對不同Lox位點的插入位置和方向進行靈活編程,實現鹼基從千比特(kb)到兆比特(Mb)尺度的大片段DNA精準無痕操縱。 研究團隊表示,他們在動植物細胞中,利用新研發的系統已成功實現18.8 kb超大片段DNA的定點整合、5 kb序列的定向替換、12 Mb的染色體倒位、4 Mb的染色體刪除及整條染色體的易位。他們還利用新型大片段DNA精準操縱技術,成功創製含315 kb精準倒位的抗除草劑水稻種質,展示出其廣泛應用前景。 據了解,AiCE成果7月上旬已在線發表於《細胞》,並將與此次研究成果以背靠背形式於8月下旬在《細胞》紙質版正式刊出。(完)
近期,上海復興島動作不小。有政策發布——7月初,《上海城市空間治理領域人工智慧應用暨量子城市空間智能建設工作實施方案》印發,提出加快復興島及周邊規劃編制實施。有土地收儲——7月中旬,百聯股份公告稱,與上海市楊浦區土地儲備中心籤訂合同,對位於共青路的三幅地塊實施收儲,總面積約15.1萬平方米。有航線開通——7月末,楊浦復興島至虹橋低空交通樞紐的低空飛行航線試飛成功,航線投入商業化運營也進入倒計時。有頂流活動——8月8日,小紅書「RED LAND」開放世界冒險島活動將登陸復興島。此前,小紅書近30萬用戶參與了答題領票;兩輪公開售票中,日間活動「巡禮票」最快3秒被搶光,全天組合聯票最快2秒被搶光。從品牌能級和傳播聲量看,目標「頂流島」的復興島,迎來首場「頂流」活動。對復興島而言,活動的喧囂背後,似乎有著更為深遠的謀劃。去年12月上海量子城市時空創新基地落地復興島以來,曾作為「戰略留白」多年的復興島,正以有機更新為路徑謀劃轉型發展。目前,復興島及周邊地區的整體規劃正在編制當中。楊浦區規劃資源局副局長成元一透露,編制工作啟動以來,已邀請許多會展企業上島,共同謀劃與「數字智能島、設計藝術島、人民城市島」風格相契合的高能級品牌活動。可見,復興島借力小紅書變身全球首座二次元「痛島」並非心血來潮。RED LAND開放世界冒險島活動,或許與復興島的後續規劃有更多契合點。復興島。契合點一,是未來城市生活的「樣板間」。考慮到夏季天氣多變,傳統漫展通常在室內舉辦;小紅書首次舉辦漫展,卻堅定選擇「難度係數」更高的戶外。小紅書社區市場負責人白板告訴記者,對於小紅書團隊來說,RED LAND活動脫胎於自身另一項品牌活動——「馬路生活節」。2023年,小紅書首屆「馬路生活節」在上海舉行。2000位小紅書博主、400個品牌商家與超20萬市民遊客,以城市為畫布繪製了一幅煙火氣與城市文化共生的生動畫卷。RED LAND活動自策劃伊始就堅定選擇戶外,正是為了更好挖掘漫展與城市生活方式的結合,打造城市生活方式的「試驗場」。與之相契合的是,復興島將聚焦科創功能,打造未來城市的「樣板間」。阿里雲智能集團時空大模型產品負責人陳怡星深度參與了復興島全球設計大賽。她說,未來城市的前沿技術,一定要在城市實景當中進行測試、迭代。復興島將為未來城市的技術提供孵化器、試驗場,成為一個未來城市生活的「最小原型」。這種模式也被稱為「living lab」(城市生活實驗室)。在荷蘭阿姆斯特丹,範哈瑟爾特運河上一家造船廠關閉後也曾留下大量工業遺存。2012年,當地市政府引進團隊,在保留廢棄船廠和船隻的基礎上進行更新改造,並引進一批環境領域的科創企業,在船廠進行各項循環技術的規模化試驗,成為未來城市循環技術的試驗場。 大量工業遺存披上「二次元」新衣。契合點二,是探索城市「睿智更新」路徑。記者近日提前登島,看到大量工業遺存披上「二次元」新衣。在船臺公園區域,高大的塔吊、斑駁的廠房巍峨依舊;巨型充氣玩偶、動漫海報標語點綴其間,讓百年船廠的工業遺存宛如煥發新生。從物理空間看,RED LAND活動的布展為工業遺存保留了大尺度留白;在虛擬世界裡,活動8萬平米空間則處處有玩法、處處有驚喜。據介紹,小紅書團隊模擬線上遊戲,首創了線下「冒險島」的玩法。玩家「登島」後,可自由選擇角色身份,領取裝備包,觸發專屬劇情線,並在近50個互動展位獲取「存檔徽章」。冒險中,不僅玩家會遇到「五步一個名場面,十步一個小冒險」;冒險關卡設計還非常契合現場環境。比如,在老舊倉庫可以體驗射擊遊戲,在樹木林立的公園還原開放世界冒險。線上IP與線下實景高度匹配帶來的沉浸式體驗感,RED LAND活動的一大特點。與之相契合的是,復興島也將探索城市「睿智更新」新模式。盤活用好存量空間資源,推動建築廠房更新利用,並試點土地儲備「標地營造」新機制。標地營造,即圍繞特定對象開展施工的過程;它與盤活存量空間資源、推動廠房更新利用等表述,都指向一個趨勢——復興島城市更新不搞大拆大建,而是長周期、漸進式的。其中邏輯不難理解:要探索戰略空間有機更新和科創策源功能耦合共生的一體化模式,需要為技術創新提供更多低成本、開放式、多元化的城市空間。相較寫字樓,技術創新更需要一片自然而然的試驗場。首創線下「冒險島」玩法。契合點三,是藍綠交織的生態底色。宛如「城市秘境」般的自然環境,是小紅書選中復興島的主要原因。「三個月前,我和項目組第一次來到上海楊浦復興島勘景。一上島,我就跟同事說,就是它了。」白板說。在他眼中,這裡地貌非常豐富又未經開發,是上海「最後一塊自留地」。他說,「這裡古樹林立,許多有年代感的倉庫、大型船臺錯落有致,與遊戲、動漫中很多場景非常契合,為活動策展帶來豐富的想像空間。」與之相契合的是,復興島建設時空智能創新實驗基地工作中,也將先行開展環島濱水空間、公園綠地等藍綠空間建設和環境提質。藍綠交織的生態底色,幾乎是所有世界級科技創新區的「標配」。今年6月,2025楊浦全球推介大會在復興島船臺公園舉行。作為復興島首個即將開放的濱水公共空間,船臺公園的前身是中華造船廠,這裡見證了中國近代造船業的發展。經過一年時間改造,如今面貌煥然一新。記者看到,公園內整潔的步道綠樹成蔭,還保留下原有20%傾斜的2號和3號船臺——當年大型船隻入水時的壯觀場景,如今仍可依稀感受。 復興島船臺公園。「頂流島」迎來首場「頂流」活動之際,未來城市的模樣,也漸漸清晰起來。
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