北京8月4日電 (記者 孫自法)在生命科學領域,基因組編輯技術的迅速發展和廣泛應用,為基礎研究和應用開發提供強大的技術支撐。不過,大片段DNA(脫氧核糖核酸)編輯一直面臨重大挑戰,對數千乃至數百萬鹼基的精準操縱更是基因編輯領域的核心難題,備受關注。 育種和基因治療有巨大應用潛力 來自中國科學院遺傳與發育生物學研究所(遺傳發育所)的消息說,該所高彩霞研究員團隊最新研發出一種新型可編程的染色體編輯技術(Programmable Chromosome Engineering,PCE)。該技術在動植物中實現了從千鹼基到兆鹼基級別DNA的多類型染色體精準操縱,顯著提升了真核生物基因組的操縱尺度和能力。 利用大片段DNA精準操縱技術,研究人員不僅能實現多基因疊加編輯,還可通過操控基因組結構變異,為作物性狀改良和遺傳疾病治療開闢新路徑。同時,該技術有望推動新型育種策略的發展,例如通過操縱遺傳連鎖、調控重組頻率實現育性控制,以及消除連鎖累贅,充分釋放野生種質資源中優異等位基因的育種潛力。此外,精準染色體編輯技術的突破將加速人工染色體構建,在合成生物學等新興領域也有重要的應用前景。 本項研究PCE系統的開發和精準染色體編輯示意圖。中國科學院遺傳發育所 供圖 這項攻克大片段DNA精準編輯的重要成果論文,北京時間8月4日深夜在國際知名學術期刊《細胞》(Cell)上線發表。審稿人評價認為,中國團隊發表的研究工作,代表了基因工程領域的重大突破,在育種和基因治療方面具有巨大的應用潛力。 系統應用受到3個關鍵問題制約 論文通訊作者高彩霞研究員介紹說,以基因編輯工具CRISPR及其衍生技術為代表的編輯系統,通過可編程的嚮導RNA(核糖核酸)引導Cas9等核酸酶靶向基因組特定位點,已廣泛應用於特定鹼基和短片段DNA的精準編輯。但針對大片段DNA編輯,現有工具在編輯效率、尺度、精準性及類型多樣性等方面仍存在明顯不足。 研究團隊發現,位點特異性重組酶(Cre-Lox)系統具有染色體水平DNA操縱潛力,其原理是在基因組中引入Lox序列後,由Cre重組酶介導Lox位點之間的DNA重組來實現全基因組範圍內的遺傳操縱。 然而,Cre-Lox系統的應用受到3個關鍵問題的制約:Lox位點固有的對稱性導致重組反應可逆,不利於目的編輯的發生;Cre酶作為四聚體工作,提升其活性的工程改造難度高;重組後特異性位點殘留,影響編輯的精準性。 構建兩個可編程染色體編輯系統 高彩霞指出,為逐一突破上述限制,在本項研究中,研究團隊構建出系統性技術路徑:首先,開發高通量重組位點快速改造平臺,並提出不對稱Lox位點設計原則,成功創製新型Lox變體,保持高效重組效率的同時將可逆重組活性降低至陰性對照水平。 其次,基於研究團隊此前自主開發的融合蛋白通用逆摺疊模型、結構與進化約束信息的蛋白定向進化平臺AiCE,實現對Cre蛋白多聚化界面的精準優化,獲得重組效率提升至3.5倍的工程化Cre蛋白變體。 最後,研究團隊創建並優化了重組酶的無痕編輯策略Re-pegRNA,利用引導編輯器的高效編輯特性,通過設計特異性pegRNA對重組後殘留的Lox位點進行「重引導編輯」,將其精準替換為原有基因組序列。 通過這三項技術的集成優化,研究團隊成功構建PCE與RePCE兩個可編程染色體編輯系統,可對不同Lox位點的插入位置和方向進行靈活編程,實現鹼基從千比特(kb)到兆比特(Mb)尺度的大片段DNA精準無痕操縱。 研究團隊表示,他們在動植物細胞中,利用新研發的系統已成功實現18.8 kb超大片段DNA的定點整合、5 kb序列的定向替換、12 Mb的染色體倒位、4 Mb的染色體刪除及整條染色體的易位。他們還利用新型大片段DNA精準操縱技術,成功創製含315 kb精準倒位的抗除草劑水稻種質,展示出其廣泛應用前景。 據了解,AiCE成果7月上旬已在線發表於《細胞》,並將與此次研究成果以背靠背形式於8月下旬在《細胞》紙質版正式刊出。(完)
升級改造標準化菜市場是今年嘉定區政府為民辦實事項目之一。據嘉定區商務委介紹,目前年度改造目標已超額完成,原計劃改造4家菜市場,如今清河農貿市集、菊勝集貿市場、惠嘉源集貿市場、洪德集貿市場、馬陸榮創市集這5家市場已煥新亮相。通過優化市場布局、完善基礎設施、提升智慧化水平等舉措,市民的購物環境和消費體驗得到了顯著改善。智慧化升級是標準化菜市場改造的重點內容。以近日開業的菊園新區菊勝集貿市場為例,多項「新科技」十分吸睛。市場內設有智慧農貿大屏,能實時滾動更新交易數據、價格指導和農殘檢測結果;新型智能電子秤採用雙面顯示屏設計,既支持商戶電子亮證,又方便消費者實時查詢菜價,還能自動採集分析交易數據;每筆交易生成的電子小票都附帶溯源二維碼,居民掃碼就能清楚了解所購商品的來源信息,讓食品安全更有保障,居民更放心。優化環境布局、豐富服務功能也是改造的關鍵內容。嘉定清河農貿市集在保留傳統果蔬生鮮區域的基礎上,創新推出了「媽媽廚房」等特色服務,提供代加工、熟食製作等貼心項目,將傳統菜市場轉變為集超市購物、特色餐飲和多元便民服務於一體的綜合型場所,讓顧客能一站式享受購物與餐飲服務。上海博慶經貿發展有限公司總經理王崢表示,該菜場開業一個月後,整體人流量從改造前的每日1500 - 2000人次躍升至3500人次,日均營業額也從12萬元提升至15萬元。馬陸榮創市集則以「超市 + 菜場 + 美食街」的複合業態模式亮相,打造了一個集購物、餐飲、休閒於一體的現代化社區商業中心。走進榮創市集生活超市,寬敞明亮的空間和科學合理的布局令人眼前一亮。超市營業面積達1500平方米,分為食品、百貨和生鮮三大板塊。其中,生鮮區是升級重點,細分為蔬菜、水果、鮮肉、麵點、烘焙、熟食六大專區。超市還匯聚了胖東來網紅產品、進口商品等特色品類,豐富了市民的選擇。「我們通過上海榮創超市有限公司的統一採購和直銷模式,減少了中間環節,進一步降低了商品價格,讓消費者能享受到更具性價比的購物體驗。」榮創市集生活超市工作人員張芮介紹,超市服務區還配備了飲水機、微波爐、洗手池、休息座椅等便民設施,充分體現了人性化服務理念。在市集的外部區域,全新升級的菜場在保留原有優質攤位的基礎上,優化了環境和布局。如今,乾淨整潔的攤位按品類整齊劃分,豆製品、海鮮水產、禽肉、蛋類、蔬菜、熟食、雜貨等一應俱全,滿足了居民的日常採購需求。毗鄰菜場的美食街匯聚了燒烤店、麵館、川湘菜館等多元餐飲,為市民提供了豐富的美食體驗。「農貿市場提檔升級後,環境明顯改善,不僅老顧客更滿意,還吸引了周邊更多居民,尤其是年輕人回流菜市場。」榮創市場負責人虞琴介紹,目前市場人流量較改造前增加了約四成。嘉定標準化菜市場的升級改造還緊密結合了「一刻鐘便民生活圈」建設理念,不斷拓展市場服務邊界。惠嘉源集貿市場(惠民黃渡集市)創新性地「開進」了鄰裡中心:一樓有麥當勞、老盛昌等知名餐飲品牌,方便居民解決一日三餐;二樓的智慧菜場和惠民超市提供水產、肉類、蔬果等16大類豐富農副產品,還特別設立了平價菜專櫃,以優惠價格讓利於民;三樓整合了黃渡黨群服務中心和「我嘉·鄰裡中心」,集中提供理髮、託育、健身等多樣化便民服務。惠嘉源試營業首日就吸引客流1.9萬人次,實現銷售額超36萬元。「集市與鄰裡中心並非簡單的物理『拼場』,而是通過科學規劃,讓居民在舒適的15分鐘步行範圍內,就能輕鬆完成買菜、辦事、學習、休閒等多種日常生活需求,實現便民生活『一站式』解決。」上海嘉定惠民超市市場經營管理有限公司黨支部副書記、副總經理沈德明解釋道。近年來,嘉定高度重視標準化菜市場的升級改造,將其作為政府實事項目,加快迭代更新步伐,進一步提升市民的消費體驗。未來,嘉定還將繼續推進此項工作,讓市民的「菜籃子」拎出幸福感。
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