北京8月4日電 (記者 孫自法)在生命科學領域,基因組編輯技術的迅速發展和廣泛應用,為基礎研究和應用開發提供強大的技術支撐。不過,大片段DNA(脫氧核糖核酸)編輯一直面臨重大挑戰,對數千乃至數百萬鹼基的精準操縱更是基因編輯領域的核心難題,備受關注。 育種和基因治療有巨大應用潛力 來自中國科學院遺傳與發育生物學研究所(遺傳發育所)的消息說,該所高彩霞研究員團隊最新研發出一種新型可編程的染色體編輯技術(Programmable Chromosome Engineering,PCE)。該技術在動植物中實現了從千鹼基到兆鹼基級別DNA的多類型染色體精準操縱,顯著提升了真核生物基因組的操縱尺度和能力。 利用大片段DNA精準操縱技術,研究人員不僅能實現多基因疊加編輯,還可通過操控基因組結構變異,為作物性狀改良和遺傳疾病治療開闢新路徑。同時,該技術有望推動新型育種策略的發展,例如通過操縱遺傳連鎖、調控重組頻率實現育性控制,以及消除連鎖累贅,充分釋放野生種質資源中優異等位基因的育種潛力。此外,精準染色體編輯技術的突破將加速人工染色體構建,在合成生物學等新興領域也有重要的應用前景。 本項研究PCE系統的開發和精準染色體編輯示意圖。中國科學院遺傳發育所 供圖 這項攻克大片段DNA精準編輯的重要成果論文,北京時間8月4日深夜在國際知名學術期刊《細胞》(Cell)上線發表。審稿人評價認為,中國團隊發表的研究工作,代表了基因工程領域的重大突破,在育種和基因治療方面具有巨大的應用潛力。 系統應用受到3個關鍵問題制約 論文通訊作者高彩霞研究員介紹說,以基因編輯工具CRISPR及其衍生技術為代表的編輯系統,通過可編程的嚮導RNA(核糖核酸)引導Cas9等核酸酶靶向基因組特定位點,已廣泛應用於特定鹼基和短片段DNA的精準編輯。但針對大片段DNA編輯,現有工具在編輯效率、尺度、精準性及類型多樣性等方面仍存在明顯不足。 研究團隊發現,位點特異性重組酶(Cre-Lox)系統具有染色體水平DNA操縱潛力,其原理是在基因組中引入Lox序列後,由Cre重組酶介導Lox位點之間的DNA重組來實現全基因組範圍內的遺傳操縱。 然而,Cre-Lox系統的應用受到3個關鍵問題的制約:Lox位點固有的對稱性導致重組反應可逆,不利於目的編輯的發生;Cre酶作為四聚體工作,提升其活性的工程改造難度高;重組後特異性位點殘留,影響編輯的精準性。 構建兩個可編程染色體編輯系統 高彩霞指出,為逐一突破上述限制,在本項研究中,研究團隊構建出系統性技術路徑:首先,開發高通量重組位點快速改造平臺,並提出不對稱Lox位點設計原則,成功創製新型Lox變體,保持高效重組效率的同時將可逆重組活性降低至陰性對照水平。 其次,基於研究團隊此前自主開發的融合蛋白通用逆摺疊模型、結構與進化約束信息的蛋白定向進化平臺AiCE,實現對Cre蛋白多聚化界面的精準優化,獲得重組效率提升至3.5倍的工程化Cre蛋白變體。 最後,研究團隊創建並優化了重組酶的無痕編輯策略Re-pegRNA,利用引導編輯器的高效編輯特性,通過設計特異性pegRNA對重組後殘留的Lox位點進行「重引導編輯」,將其精準替換為原有基因組序列。 通過這三項技術的集成優化,研究團隊成功構建PCE與RePCE兩個可編程染色體編輯系統,可對不同Lox位點的插入位置和方向進行靈活編程,實現鹼基從千比特(kb)到兆比特(Mb)尺度的大片段DNA精準無痕操縱。 研究團隊表示,他們在動植物細胞中,利用新研發的系統已成功實現18.8 kb超大片段DNA的定點整合、5 kb序列的定向替換、12 Mb的染色體倒位、4 Mb的染色體刪除及整條染色體的易位。他們還利用新型大片段DNA精準操縱技術,成功創製含315 kb精準倒位的抗除草劑水稻種質,展示出其廣泛應用前景。 據了解,AiCE成果7月上旬已在線發表於《細胞》,並將與此次研究成果以背靠背形式於8月下旬在《細胞》紙質版正式刊出。(完)
成都8月12日電 題:「熊貓故裡」的世運奇緣 作者 賀劭清 袁牟知博 董澤宇 「參加成都世運會是一次非常愉快的經歷,現在我像喜愛大熊貓一樣喜愛中國的一切。」在世運村外的好運市集,成都世運會葡萄牙運動員米格爾·裡貝羅一天就交換了15枚大熊貓主題徽章。 8月9日,空手道61公斤級冠軍龔莉(中)與亞軍、季軍選手拿著大熊貓元素的獎牌、紀念品自拍合影。 記者 田雨昊 攝 會徽藏著大熊貓,吉祥物之一的「蜀寶」源於大熊貓,獎牌造型是大熊貓,就連火炬都是大熊貓愛吃的竹子造型……正在「大熊貓故鄉」中國成都舉行的世運會,無處不在的大熊貓元素為各國運動員帶來驚喜,也為他們打開了一扇了解中國的窗。 米格爾·裡貝羅說,交換大熊貓徽章的過程,能快速拉近人與人之間的距離。很多中國人在交換徽章時,會和他分享不同的大熊貓故事。「中國人給大熊貓取了名字,我很難區分每隻大熊貓的不同,但是我從這些保護大熊貓的故事中,看到一個比書本上更可愛的中國。」 賽場外,大熊貓元素被廣泛融入成都世運會民俗活動、非遺體驗以及氛圍裝飾中。看到餐廳外出現大熊貓人偶,奧地利手球隊隊員們衝出餐廳與其合影。「大熊貓對我們來說有與眾不同的魅力,非常可愛!」奧地利手球隊隊員韋格爾感嘆。 賽場內,從場館布置到頒獎物資,大熊貓元素亦無處不在。水面蹼泳接力比賽金牌得主許藝川和舒程靜奪冠後迫不及待地「曬」起新收穫:除了外形神似大熊貓頭部的獎牌,還有一套大熊貓川劇造型的擺件。 德國拉丁舞組合成員赫裡斯蒂娜·莫申斯卡同樣被獎牌上的大熊貓元素驚喜:「我之前得過世運會獎牌,但是這次獎牌特別不一樣,我看到一隻大熊貓!」 美國棍網球運動員夏洛特·諾思在獎牌之外,還得到一隻大熊貓「花花」玩偶。她的隊友卡茜迪·威克斯透露,全隊姑娘們已搶先探訪了成都大熊貓繁育研究基地。 連日來,成都大熊貓繁育研究基地內隨處可見世運健兒。比利時拔河運動員馬克斯身披雨衣,用手機專註記錄大熊貓雨中嬉戲萌態。「我在比利時動物園見過大熊貓,成都能一次性看到這麼多大熊貓,實在太幸福了!」 墨西哥殘疾人柔術運動員莫雷諾選購了滿滿一背包大熊貓周邊——徽章、冰箱貼……他感慨道:「在大熊貓真正的家園見到大熊貓,成都世運會藏著太多驚喜。」(完)
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