北京8月4日電 (記者 孫自法)在生命科學領域,基因組編輯技術的迅速發展和廣泛應用,為基礎研究和應用開發提供強大的技術支撐。不過,大片段DNA(脫氧核糖核酸)編輯一直面臨重大挑戰,對數千乃至數百萬鹼基的精準操縱更是基因編輯領域的核心難題,備受關注。 育種和基因治療有巨大應用潛力 來自中國科學院遺傳與發育生物學研究所(遺傳發育所)的消息說,該所高彩霞研究員團隊最新研發出一種新型可編程的染色體編輯技術(Programmable Chromosome Engineering,PCE)。該技術在動植物中實現了從千鹼基到兆鹼基級別DNA的多類型染色體精準操縱,顯著提升了真核生物基因組的操縱尺度和能力。 利用大片段DNA精準操縱技術,研究人員不僅能實現多基因疊加編輯,還可通過操控基因組結構變異,為作物性狀改良和遺傳疾病治療開闢新路徑。同時,該技術有望推動新型育種策略的發展,例如通過操縱遺傳連鎖、調控重組頻率實現育性控制,以及消除連鎖累贅,充分釋放野生種質資源中優異等位基因的育種潛力。此外,精準染色體編輯技術的突破將加速人工染色體構建,在合成生物學等新興領域也有重要的應用前景。 本項研究PCE系統的開發和精準染色體編輯示意圖。中國科學院遺傳發育所 供圖 這項攻克大片段DNA精準編輯的重要成果論文,北京時間8月4日深夜在國際知名學術期刊《細胞》(Cell)上線發表。審稿人評價認為,中國團隊發表的研究工作,代表了基因工程領域的重大突破,在育種和基因治療方面具有巨大的應用潛力。 系統應用受到3個關鍵問題制約 論文通訊作者高彩霞研究員介紹說,以基因編輯工具CRISPR及其衍生技術為代表的編輯系統,通過可編程的嚮導RNA(核糖核酸)引導Cas9等核酸酶靶向基因組特定位點,已廣泛應用於特定鹼基和短片段DNA的精準編輯。但針對大片段DNA編輯,現有工具在編輯效率、尺度、精準性及類型多樣性等方面仍存在明顯不足。 研究團隊發現,位點特異性重組酶(Cre-Lox)系統具有染色體水平DNA操縱潛力,其原理是在基因組中引入Lox序列後,由Cre重組酶介導Lox位點之間的DNA重組來實現全基因組範圍內的遺傳操縱。 然而,Cre-Lox系統的應用受到3個關鍵問題的制約:Lox位點固有的對稱性導致重組反應可逆,不利於目的編輯的發生;Cre酶作為四聚體工作,提升其活性的工程改造難度高;重組後特異性位點殘留,影響編輯的精準性。 構建兩個可編程染色體編輯系統 高彩霞指出,為逐一突破上述限制,在本項研究中,研究團隊構建出系統性技術路徑:首先,開發高通量重組位點快速改造平臺,並提出不對稱Lox位點設計原則,成功創製新型Lox變體,保持高效重組效率的同時將可逆重組活性降低至陰性對照水平。 其次,基於研究團隊此前自主開發的融合蛋白通用逆摺疊模型、結構與進化約束信息的蛋白定向進化平臺AiCE,實現對Cre蛋白多聚化界面的精準優化,獲得重組效率提升至3.5倍的工程化Cre蛋白變體。 最後,研究團隊創建並優化了重組酶的無痕編輯策略Re-pegRNA,利用引導編輯器的高效編輯特性,通過設計特異性pegRNA對重組後殘留的Lox位點進行「重引導編輯」,將其精準替換為原有基因組序列。 通過這三項技術的集成優化,研究團隊成功構建PCE與RePCE兩個可編程染色體編輯系統,可對不同Lox位點的插入位置和方向進行靈活編程,實現鹼基從千比特(kb)到兆比特(Mb)尺度的大片段DNA精準無痕操縱。 研究團隊表示,他們在動植物細胞中,利用新研發的系統已成功實現18.8 kb超大片段DNA的定點整合、5 kb序列的定向替換、12 Mb的染色體倒位、4 Mb的染色體刪除及整條染色體的易位。他們還利用新型大片段DNA精準操縱技術,成功創製含315 kb精準倒位的抗除草劑水稻種質,展示出其廣泛應用前景。 據了解,AiCE成果7月上旬已在線發表於《細胞》,並將與此次研究成果以背靠背形式於8月下旬在《細胞》紙質版正式刊出。(完)
臺北8月9日電 (記者 朱賀)「中醫藥既具療效,又讓民眾負擔得起,這是我們老祖宗的智慧。希望兩岸攜手傳承,讓人工智慧(AI)更好賦能中醫藥診療。」9日,臺灣花蓮慈濟醫院院長林欣榮在臺北接受記者採訪時說。 人工智慧,無疑是當下兩岸最流行的關鍵詞之一。正在舉行的臺灣第二屆高齡健康產業博覽會上,人工智慧應用隨處可見。走到慈濟展位,不少參觀者佩戴VR眼鏡體驗中醫「望聞問切」,通過AI設備接受經絡檢測。 8月9日,臺灣第二屆高齡健康產業博覽會正在臺北舉行。圖為參觀民眾在佩戴VR眼鏡體驗中醫「望聞問切」。記者 朱賀 攝 據臺當局8日公布的最新統計數據,截至7月底,臺灣人口總數為23337936人,已連續19個月負增長;65歲以上人口數為4583678人,幾乎佔總人口的兩成,顯示臺灣正邁向「超高齡社會」。 林欣榮介紹,人工智慧賦能精準醫療,讓更多民眾,尤其是年長者得到及時有效的照護。以花蓮慈濟醫院為例,他介紹,花蓮多山,當地民眾對現代診療方式的需求迫切。該院引用AI診療,幫助醫師對罹患失智、帕金森病的老人進行更精準檢查,以便在早期幹預、後期治療中找到更對症的治療藥物。 致力於推動中西醫結合診療與中草藥研究多年,林欣榮特別提及,西藥價格高昂,中藥物美價廉、副作用更小,民眾接受度更高,如今在人工智慧幫助下,該院推動以中草藥精準治療癌症、中風及罕見病等疾病已取得一定成果。 「一些長輩出行困難,但足不出戶就能和機器人交流對話、得到照護,漸漸走出陰霾。」談及赴大陸參加兩岸醫藥交流活動的見聞,林欣榮說,無論醫藥衛生還是生物科技,大陸各領域人工智慧發展速度都很快。他表示,兩岸都秉承「大健康」理念,診療之外也注重健康促進,冀望兩岸一起努力,讓現代技術更好服務於醫藥健康。(完)
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