北京8月4日電 (記者 孫自法)在生命科學領域,基因組編輯技術的迅速發展和廣泛應用,為基礎研究和應用開發提供強大的技術支撐。不過,大片段DNA(脫氧核糖核酸)編輯一直面臨重大挑戰,對數千乃至數百萬鹼基的精準操縱更是基因編輯領域的核心難題,備受關注。 育種和基因治療有巨大應用潛力 來自中國科學院遺傳與發育生物學研究所(遺傳發育所)的消息說,該所高彩霞研究員團隊最新研發出一種新型可編程的染色體編輯技術(Programmable Chromosome Engineering,PCE)。該技術在動植物中實現了從千鹼基到兆鹼基級別DNA的多類型染色體精準操縱,顯著提升了真核生物基因組的操縱尺度和能力。 利用大片段DNA精準操縱技術,研究人員不僅能實現多基因疊加編輯,還可通過操控基因組結構變異,為作物性狀改良和遺傳疾病治療開闢新路徑。同時,該技術有望推動新型育種策略的發展,例如通過操縱遺傳連鎖、調控重組頻率實現育性控制,以及消除連鎖累贅,充分釋放野生種質資源中優異等位基因的育種潛力。此外,精準染色體編輯技術的突破將加速人工染色體構建,在合成生物學等新興領域也有重要的應用前景。 本項研究PCE系統的開發和精準染色體編輯示意圖。中國科學院遺傳發育所 供圖 這項攻克大片段DNA精準編輯的重要成果論文,北京時間8月4日深夜在國際知名學術期刊《細胞》(Cell)上線發表。審稿人評價認為,中國團隊發表的研究工作,代表了基因工程領域的重大突破,在育種和基因治療方面具有巨大的應用潛力。 系統應用受到3個關鍵問題制約 論文通訊作者高彩霞研究員介紹說,以基因編輯工具CRISPR及其衍生技術為代表的編輯系統,通過可編程的嚮導RNA(核糖核酸)引導Cas9等核酸酶靶向基因組特定位點,已廣泛應用於特定鹼基和短片段DNA的精準編輯。但針對大片段DNA編輯,現有工具在編輯效率、尺度、精準性及類型多樣性等方面仍存在明顯不足。 研究團隊發現,位點特異性重組酶(Cre-Lox)系統具有染色體水平DNA操縱潛力,其原理是在基因組中引入Lox序列後,由Cre重組酶介導Lox位點之間的DNA重組來實現全基因組範圍內的遺傳操縱。 然而,Cre-Lox系統的應用受到3個關鍵問題的制約:Lox位點固有的對稱性導致重組反應可逆,不利於目的編輯的發生;Cre酶作為四聚體工作,提升其活性的工程改造難度高;重組後特異性位點殘留,影響編輯的精準性。 構建兩個可編程染色體編輯系統 高彩霞指出,為逐一突破上述限制,在本項研究中,研究團隊構建出系統性技術路徑:首先,開發高通量重組位點快速改造平臺,並提出不對稱Lox位點設計原則,成功創製新型Lox變體,保持高效重組效率的同時將可逆重組活性降低至陰性對照水平。 其次,基於研究團隊此前自主開發的融合蛋白通用逆摺疊模型、結構與進化約束信息的蛋白定向進化平臺AiCE,實現對Cre蛋白多聚化界面的精準優化,獲得重組效率提升至3.5倍的工程化Cre蛋白變體。 最後,研究團隊創建並優化了重組酶的無痕編輯策略Re-pegRNA,利用引導編輯器的高效編輯特性,通過設計特異性pegRNA對重組後殘留的Lox位點進行「重引導編輯」,將其精準替換為原有基因組序列。 通過這三項技術的集成優化,研究團隊成功構建PCE與RePCE兩個可編程染色體編輯系統,可對不同Lox位點的插入位置和方向進行靈活編程,實現鹼基從千比特(kb)到兆比特(Mb)尺度的大片段DNA精準無痕操縱。 研究團隊表示,他們在動植物細胞中,利用新研發的系統已成功實現18.8 kb超大片段DNA的定點整合、5 kb序列的定向替換、12 Mb的染色體倒位、4 Mb的染色體刪除及整條染色體的易位。他們還利用新型大片段DNA精準操縱技術,成功創製含315 kb精準倒位的抗除草劑水稻種質,展示出其廣泛應用前景。 據了解,AiCE成果7月上旬已在線發表於《細胞》,並將與此次研究成果以背靠背形式於8月下旬在《細胞》紙質版正式刊出。(完)
空氣品質與百姓生活息息相關。習近平總書記指出,還老百姓藍天白雲、繁星閃爍。黨的十八大以來,大氣汙染治理跑出中國加速度,日益增多的藍天白雲,給百姓帶來實實在在的幸福感。今天(8月10日)的《感知生態之變》,讓我們一起來看這場「藍天保衛戰」帶來的變化。 霧霾少了 鋼鐵廠綠意蔥蔥 蕩鞦韆,餵大鵝,誰會想到,這是在邢臺的一家正在生產的鋼鐵廠裡。每到周末,大批遊客的到來讓廠門口的小超市都跟著紅火了起來。 超市店主 張紅云:飲料、冰棍,小朋友的玩具賣得可好了,以前我們這人都不願來,空氣都嗆人。 空氣,曾經是邢臺深深的痛。2013年,在全國74個重點監測城市中,邢臺排名倒數第一。 這是當時,環境監測衛星拍到的德龍鋼鐵廠,霧霾最嚴重的時候幾乎看不出廠區輪廓。而如今,卻是清晰可見,綠意蔥蔥。 鋼鐵行業的變化,只是中國打贏藍天保衛戰的一個縮影。 為了還藍天給百姓,國家相繼展開大氣汙染防治行動、打贏藍天保衛戰三年行動和空氣品質持續改善行動,2013年以來,重汙染天數減少超過90%,中國成為世界上空氣品質改善速度最快的國家。 藍天在增多 空氣中都是花草樹木的芬芳 藍天在增多,空氣裡的氣味也在發生著變化。清華大學研究團隊用嗅覺可視化技術,還原出了氣味的變遷過程。 清華大學未來實驗室嗅覺計算研究組群負責人 路奇:10年前我們經常能聞到煤煙味,這是PM10這種顆粒物的含量非常高。還有像燒焦的火柴頭味、消毒水味,這是屬於二氧化硫、二氧化氮的含量很高。十年間,這些汙染物含量大幅下降。現在不僅聞不到這些難聞的氣味,同時我們在做實驗的過程中會越來越多地檢測到蒎烯、檸檬烯等化合物,這些是屬於花草樹木所散發出來的芬芳。 空天地一體化 上億條數據展現精準治理 氣味變遷的背後,是中國空氣治理越來越精準的腳步。 在北京,一張精密的空天地一體化「感知網絡」,將3000多條路網、20萬輛重型柴油車、2000多個工地、上千家涉氣企業納入監測,每天匯集上億條數據展開精準治理。 北京市生態環境局大氣環境處處長 謝金開:這些年,北京PM2.5的年均濃度已經從每立方米近90微克下降到30.5微克,但是想再進一步改善,需要0.1微克、0.1微克地去摳,抓住每一點改善的可能性。 我們對339個城市十年間發布的空氣數據進行分析,發現每立方米空氣中的PM2.5減少了將近40%,隨之而來的,每個城市的藍天平均數增長了22天。 如今的中國,藍天白雲已不再是奢望,人們從天津的樓頂可以直接遙望北京CBD。在成都的家門口就能拍到200公裡外的雪山美景。各地公布的觀星點位比2016年增加了20倍。 北京市民:現在藍天白雲不是新鮮事了,要趕上霧霾天那才是新鮮事。 北京市民:原來就是看見藍天就想拍照,現在可不是了,有晚霞、彩虹,我們才拍照。空氣好了,我們審美都提高了。
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