北京8月4日電 (記者 孫自法)在生命科學領域,基因組編輯技術的迅速發展和廣泛應用,為基礎研究和應用開發提供強大的技術支撐。不過,大片段DNA(脫氧核糖核酸)編輯一直面臨重大挑戰,對數千乃至數百萬鹼基的精準操縱更是基因編輯領域的核心難題,備受關注。 育種和基因治療有巨大應用潛力 來自中國科學院遺傳與發育生物學研究所(遺傳發育所)的消息說,該所高彩霞研究員團隊最新研發出一種新型可編程的染色體編輯技術(Programmable Chromosome Engineering,PCE)。該技術在動植物中實現了從千鹼基到兆鹼基級別DNA的多類型染色體精準操縱,顯著提升了真核生物基因組的操縱尺度和能力。 利用大片段DNA精準操縱技術,研究人員不僅能實現多基因疊加編輯,還可通過操控基因組結構變異,為作物性狀改良和遺傳疾病治療開闢新路徑。同時,該技術有望推動新型育種策略的發展,例如通過操縱遺傳連鎖、調控重組頻率實現育性控制,以及消除連鎖累贅,充分釋放野生種質資源中優異等位基因的育種潛力。此外,精準染色體編輯技術的突破將加速人工染色體構建,在合成生物學等新興領域也有重要的應用前景。 本項研究PCE系統的開發和精準染色體編輯示意圖。中國科學院遺傳發育所 供圖 這項攻克大片段DNA精準編輯的重要成果論文,北京時間8月4日深夜在國際知名學術期刊《細胞》(Cell)上線發表。審稿人評價認為,中國團隊發表的研究工作,代表了基因工程領域的重大突破,在育種和基因治療方面具有巨大的應用潛力。 系統應用受到3個關鍵問題制約 論文通訊作者高彩霞研究員介紹說,以基因編輯工具CRISPR及其衍生技術為代表的編輯系統,通過可編程的嚮導RNA(核糖核酸)引導Cas9等核酸酶靶向基因組特定位點,已廣泛應用於特定鹼基和短片段DNA的精準編輯。但針對大片段DNA編輯,現有工具在編輯效率、尺度、精準性及類型多樣性等方面仍存在明顯不足。 研究團隊發現,位點特異性重組酶(Cre-Lox)系統具有染色體水平DNA操縱潛力,其原理是在基因組中引入Lox序列後,由Cre重組酶介導Lox位點之間的DNA重組來實現全基因組範圍內的遺傳操縱。 然而,Cre-Lox系統的應用受到3個關鍵問題的制約:Lox位點固有的對稱性導致重組反應可逆,不利於目的編輯的發生;Cre酶作為四聚體工作,提升其活性的工程改造難度高;重組後特異性位點殘留,影響編輯的精準性。 構建兩個可編程染色體編輯系統 高彩霞指出,為逐一突破上述限制,在本項研究中,研究團隊構建出系統性技術路徑:首先,開發高通量重組位點快速改造平臺,並提出不對稱Lox位點設計原則,成功創製新型Lox變體,保持高效重組效率的同時將可逆重組活性降低至陰性對照水平。 其次,基於研究團隊此前自主開發的融合蛋白通用逆摺疊模型、結構與進化約束信息的蛋白定向進化平臺AiCE,實現對Cre蛋白多聚化界面的精準優化,獲得重組效率提升至3.5倍的工程化Cre蛋白變體。 最後,研究團隊創建並優化了重組酶的無痕編輯策略Re-pegRNA,利用引導編輯器的高效編輯特性,通過設計特異性pegRNA對重組後殘留的Lox位點進行「重引導編輯」,將其精準替換為原有基因組序列。 通過這三項技術的集成優化,研究團隊成功構建PCE與RePCE兩個可編程染色體編輯系統,可對不同Lox位點的插入位置和方向進行靈活編程,實現鹼基從千比特(kb)到兆比特(Mb)尺度的大片段DNA精準無痕操縱。 研究團隊表示,他們在動植物細胞中,利用新研發的系統已成功實現18.8 kb超大片段DNA的定點整合、5 kb序列的定向替換、12 Mb的染色體倒位、4 Mb的染色體刪除及整條染色體的易位。他們還利用新型大片段DNA精準操縱技術,成功創製含315 kb精準倒位的抗除草劑水稻種質,展示出其廣泛應用前景。 據了解,AiCE成果7月上旬已在線發表於《細胞》,並將與此次研究成果以背靠背形式於8月下旬在《細胞》紙質版正式刊出。(完)
蘭州8月8日電 (艾慶龍 高展)「差池上舟楫,杳窕入雲漢。」杜甫行舟嘉陵江徽縣段留下的詩句,勾勒出這片峽谷往昔的熱鬧圖景。而同在這片土地,李白筆下「青泥何盤盤,百步九折縈巖巒」的青泥嶺也在徽縣南境,道出了嘉陵江周邊蜀道的艱險。一靜一動間,早已將這片山水的靈秀與崎嶇刻入歷史。 近日,沿著新修的道路來到甘肅省隴南市徽縣,跟著詩句走進月亮峽,10公裡的路程已不再是往昔的險峻模樣。龜溪潺潺流淌,廊亭依水而建,彎月景觀前不時有遊客駐足拍照,曾經難行的路段如今架起了親水平臺,幾位旅客望著江景閒談。 當地村民說,路通了,景也串起來了,來的人一年比一年多。不遠處的田河村,1277米的繞行新路讓進出的車輛不再擁堵,5畝生態停車場裡,掛著陝、甘、川等地牌照的私家車整齊停放,很難想像這裡曾因停車難讓不少遊客遺憾折返。 圖為甘肅省隴南市徽縣田河村千年銀杏樹。(資料圖)高瓊 攝 田河村的千年銀杏樹下,更是一派生機。「銀杏夢谷」民宿的火鍋集市廣場上,升騰的熱氣伴著陣陣香氣,遊客品嘗著當地特色火鍋,聊著沿途見聞。獨棟別院式民宿前,新人依偎在銀杏樹下拍攝婚紗照。 樹下的空地上,村民們擺著小攤,銀杏果點心、自釀的土酒擺了滿滿一排,旁邊的非遺體驗區裡,孩子們跟著手藝人學做竹編,不時傳出歡快的笑聲。這種「高端民宿+農家風味+非遺互動」的組合,不僅讓遊客玩得盡興,也讓村民的日子越過越紅火。 13公裡長的嘉陵江漂流河道上,不時傳來陣陣吶喊。一艘艘橡皮艇順著蜿蜒的河道而下,兩岸的青山飛速後退,遊客們在驚險與愜意中感受著山水之樂。岸邊工作人員說,每到周末和節假日,漂流項目都要提前預約。 圖為嘉陵江徽縣段。(資料圖)高瓊 攝 這僅是當地文旅活力的一個縮影,「一月一活動」的安排讓景區四季都有看點,「銀杏杯」和美鄉村籃球邀請賽上,村民與遊客組隊比拼,賽場外的農特產品攤位也被圍得滿滿當當,單場活動就帶動銷售超10萬元;短視頻大賽裡,網友們鏡頭下的銀杏林、漂流河、古村落,讓更多人知道了這個藏在嘉陵江岸畔的好去處。 數據見證著變化:2025年一季度,徽縣旅遊人數達75.5萬人次,旅遊花費4.028億元,同比增幅均接近29%。但發展中遇到的難題也曾讓人犯難,景區網絡信號弱,遊客發個視頻都要四處找信號,如今田河村完成網絡擴容,走到哪兒都是滿格信號;隧道照明不足,夜間行車讓人心裡發慌,現在照明方案已定,施工隊即將進場;宣傳方式單一、留宿遊客統計不準,通過短視頻大賽和與多部門合作規範登記,這些問題也在逐步解決。 傍晚時分,嘉陵古鎮的建設工地上依舊機器轟鳴。按照規劃,這裡將與三國文化展示館一同,把當地的歷史故事講給更多人聽。遠處,漂流的號子漸漸平息,民宿裡亮起燈光,千年銀杏的葉子在風中輕輕作響。(完)
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