北京8月4日電 (記者 孫自法)在生命科學領域,基因組編輯技術的迅速發展和廣泛應用,為基礎研究和應用開發提供強大的技術支撐。不過,大片段DNA(脫氧核糖核酸)編輯一直面臨重大挑戰,對數千乃至數百萬鹼基的精準操縱更是基因編輯領域的核心難題,備受關注。 育種和基因治療有巨大應用潛力 來自中國科學院遺傳與發育生物學研究所(遺傳發育所)的消息說,該所高彩霞研究員團隊最新研發出一種新型可編程的染色體編輯技術(Programmable Chromosome Engineering,PCE)。該技術在動植物中實現了從千鹼基到兆鹼基級別DNA的多類型染色體精準操縱,顯著提升了真核生物基因組的操縱尺度和能力。 利用大片段DNA精準操縱技術,研究人員不僅能實現多基因疊加編輯,還可通過操控基因組結構變異,為作物性狀改良和遺傳疾病治療開闢新路徑。同時,該技術有望推動新型育種策略的發展,例如通過操縱遺傳連鎖、調控重組頻率實現育性控制,以及消除連鎖累贅,充分釋放野生種質資源中優異等位基因的育種潛力。此外,精準染色體編輯技術的突破將加速人工染色體構建,在合成生物學等新興領域也有重要的應用前景。 本項研究PCE系統的開發和精準染色體編輯示意圖。中國科學院遺傳發育所 供圖 這項攻克大片段DNA精準編輯的重要成果論文,北京時間8月4日深夜在國際知名學術期刊《細胞》(Cell)上線發表。審稿人評價認為,中國團隊發表的研究工作,代表了基因工程領域的重大突破,在育種和基因治療方面具有巨大的應用潛力。 系統應用受到3個關鍵問題制約 論文通訊作者高彩霞研究員介紹說,以基因編輯工具CRISPR及其衍生技術為代表的編輯系統,通過可編程的嚮導RNA(核糖核酸)引導Cas9等核酸酶靶向基因組特定位點,已廣泛應用於特定鹼基和短片段DNA的精準編輯。但針對大片段DNA編輯,現有工具在編輯效率、尺度、精準性及類型多樣性等方面仍存在明顯不足。 研究團隊發現,位點特異性重組酶(Cre-Lox)系統具有染色體水平DNA操縱潛力,其原理是在基因組中引入Lox序列後,由Cre重組酶介導Lox位點之間的DNA重組來實現全基因組範圍內的遺傳操縱。 然而,Cre-Lox系統的應用受到3個關鍵問題的制約:Lox位點固有的對稱性導致重組反應可逆,不利於目的編輯的發生;Cre酶作為四聚體工作,提升其活性的工程改造難度高;重組後特異性位點殘留,影響編輯的精準性。 構建兩個可編程染色體編輯系統 高彩霞指出,為逐一突破上述限制,在本項研究中,研究團隊構建出系統性技術路徑:首先,開發高通量重組位點快速改造平臺,並提出不對稱Lox位點設計原則,成功創製新型Lox變體,保持高效重組效率的同時將可逆重組活性降低至陰性對照水平。 其次,基於研究團隊此前自主開發的融合蛋白通用逆摺疊模型、結構與進化約束信息的蛋白定向進化平臺AiCE,實現對Cre蛋白多聚化界面的精準優化,獲得重組效率提升至3.5倍的工程化Cre蛋白變體。 最後,研究團隊創建並優化了重組酶的無痕編輯策略Re-pegRNA,利用引導編輯器的高效編輯特性,通過設計特異性pegRNA對重組後殘留的Lox位點進行「重引導編輯」,將其精準替換為原有基因組序列。 通過這三項技術的集成優化,研究團隊成功構建PCE與RePCE兩個可編程染色體編輯系統,可對不同Lox位點的插入位置和方向進行靈活編程,實現鹼基從千比特(kb)到兆比特(Mb)尺度的大片段DNA精準無痕操縱。 研究團隊表示,他們在動植物細胞中,利用新研發的系統已成功實現18.8 kb超大片段DNA的定點整合、5 kb序列的定向替換、12 Mb的染色體倒位、4 Mb的染色體刪除及整條染色體的易位。他們還利用新型大片段DNA精準操縱技術,成功創製含315 kb精準倒位的抗除草劑水稻種質,展示出其廣泛應用前景。 據了解,AiCE成果7月上旬已在線發表於《細胞》,並將與此次研究成果以背靠背形式於8月下旬在《細胞》紙質版正式刊出。(完)
上海8月14日電 (記者 王笈)由中共上海市委宣傳部指導、上海世紀出版集團主辦、上海人民出版社承辦的「助力現代化人民城市建設——哲學社會科學『五大文庫』首發式暨學術研討會」14日在上海舉行,揭幕「五大文庫」首批共43種新書,科學回答中國之問、世界之問、時代之問。 作為哲學社會科學領域的開放式叢書,「五大文庫」強化整體性、系統性研究,既運用各學科資源呈現理論學理深度,又立足上海實際反映實踐厚度,是體現歷史邏輯、理論邏輯、實踐邏輯相統一的最新主題出版成果。 此次推出的首批新書,涵蓋黨的創新理論體系化學理化研究、中國哲學社會科學自主知識體系建構、高端智庫決策諮詢、社科名家代表性成果、青年學者原創研究五大板塊,為現代化人民城市建設提供理論闡釋、智力支撐和人才保障。 其中,「黨的創新理論體系化學理化研究文庫」聚焦「原理體系」和「上海實踐」,既強化整體性、系統性研究,又注重從不同領域深入闡釋。 「中國哲學社會科學自主知識體系文庫」鼓勵專家學者立足中國國情和上海改革創新實踐,深入研究哲學社會科學各學科領域的標識性重大概念、原創性思想觀點、原理性理論,推動上海哲學社會科學學術創新高地建設。 「上海智庫報告文庫」採取管理部門、智庫機構、出版社跨界合作的創新模式,圍繞全球治理、國家戰略、上海發展中的重大理論和現實問題,遴選具有較強理論說服力、實踐指導力和決策參考價值的智庫研究成果集中出版。 「上海社科名家文庫」主要資助具有重要學術影響的專家學者近期完成的代表性、標誌性成果,發揮社科名家對上海哲學社會科學事業發展的示範引領作用。 「上海社科新人文庫」重點支持哲學社會科學相關領域青年學者在新興學科、交叉學科、冷門學科等領域開展的原創性、前沿性研究成果,為青年人才搭建成長平臺、暢通上升渠道。 與會人員表示,「五大文庫」創新工程的實施,將為加快構建中國哲學社會科學自主知識體系,開創具有中國特色、中國風格、中國氣派的哲學社會科學發展新局面貢獻力量。(完)
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