北京8月4日電 (記者 孫自法)在生命科學領域,基因組編輯技術的迅速發展和廣泛應用,為基礎研究和應用開發提供強大的技術支撐。不過,大片段DNA(脫氧核糖核酸)編輯一直面臨重大挑戰,對數千乃至數百萬鹼基的精準操縱更是基因編輯領域的核心難題,備受關注。 育種和基因治療有巨大應用潛力 來自中國科學院遺傳與發育生物學研究所(遺傳發育所)的消息說,該所高彩霞研究員團隊最新研發出一種新型可編程的染色體編輯技術(Programmable Chromosome Engineering,PCE)。該技術在動植物中實現了從千鹼基到兆鹼基級別DNA的多類型染色體精準操縱,顯著提升了真核生物基因組的操縱尺度和能力。 利用大片段DNA精準操縱技術,研究人員不僅能實現多基因疊加編輯,還可通過操控基因組結構變異,為作物性狀改良和遺傳疾病治療開闢新路徑。同時,該技術有望推動新型育種策略的發展,例如通過操縱遺傳連鎖、調控重組頻率實現育性控制,以及消除連鎖累贅,充分釋放野生種質資源中優異等位基因的育種潛力。此外,精準染色體編輯技術的突破將加速人工染色體構建,在合成生物學等新興領域也有重要的應用前景。 本項研究PCE系統的開發和精準染色體編輯示意圖。中國科學院遺傳發育所 供圖 這項攻克大片段DNA精準編輯的重要成果論文,北京時間8月4日深夜在國際知名學術期刊《細胞》(Cell)上線發表。審稿人評價認為,中國團隊發表的研究工作,代表了基因工程領域的重大突破,在育種和基因治療方面具有巨大的應用潛力。 系統應用受到3個關鍵問題制約 論文通訊作者高彩霞研究員介紹說,以基因編輯工具CRISPR及其衍生技術為代表的編輯系統,通過可編程的嚮導RNA(核糖核酸)引導Cas9等核酸酶靶向基因組特定位點,已廣泛應用於特定鹼基和短片段DNA的精準編輯。但針對大片段DNA編輯,現有工具在編輯效率、尺度、精準性及類型多樣性等方面仍存在明顯不足。 研究團隊發現,位點特異性重組酶(Cre-Lox)系統具有染色體水平DNA操縱潛力,其原理是在基因組中引入Lox序列後,由Cre重組酶介導Lox位點之間的DNA重組來實現全基因組範圍內的遺傳操縱。 然而,Cre-Lox系統的應用受到3個關鍵問題的制約:Lox位點固有的對稱性導致重組反應可逆,不利於目的編輯的發生;Cre酶作為四聚體工作,提升其活性的工程改造難度高;重組後特異性位點殘留,影響編輯的精準性。 構建兩個可編程染色體編輯系統 高彩霞指出,為逐一突破上述限制,在本項研究中,研究團隊構建出系統性技術路徑:首先,開發高通量重組位點快速改造平臺,並提出不對稱Lox位點設計原則,成功創製新型Lox變體,保持高效重組效率的同時將可逆重組活性降低至陰性對照水平。 其次,基於研究團隊此前自主開發的融合蛋白通用逆摺疊模型、結構與進化約束信息的蛋白定向進化平臺AiCE,實現對Cre蛋白多聚化界面的精準優化,獲得重組效率提升至3.5倍的工程化Cre蛋白變體。 最後,研究團隊創建並優化了重組酶的無痕編輯策略Re-pegRNA,利用引導編輯器的高效編輯特性,通過設計特異性pegRNA對重組後殘留的Lox位點進行「重引導編輯」,將其精準替換為原有基因組序列。 通過這三項技術的集成優化,研究團隊成功構建PCE與RePCE兩個可編程染色體編輯系統,可對不同Lox位點的插入位置和方向進行靈活編程,實現鹼基從千比特(kb)到兆比特(Mb)尺度的大片段DNA精準無痕操縱。 研究團隊表示,他們在動植物細胞中,利用新研發的系統已成功實現18.8 kb超大片段DNA的定點整合、5 kb序列的定向替換、12 Mb的染色體倒位、4 Mb的染色體刪除及整條染色體的易位。他們還利用新型大片段DNA精準操縱技術,成功創製含315 kb精準倒位的抗除草劑水稻種質,展示出其廣泛應用前景。 據了解,AiCE成果7月上旬已在線發表於《細胞》,並將與此次研究成果以背靠背形式於8月下旬在《細胞》紙質版正式刊出。(完)
拉薩8月12日電 題:斯朗旺扎的鐵路人生:從馬背少年到高原復興號司機 記者 江飛波 「2003年,我離開西藏去甘肅蘭州讀書,在青海格爾木第一次坐上綠皮火車時,感覺太酷了,又快又穩。」近日,中國鐵路青藏集團有限公司格爾木機務段火車司機斯朗旺扎在受訪時回憶第一次乘坐火車。 目前,38歲的斯朗旺扎主要駕駛高原復興號行駛在西藏拉林鐵路和拉日鐵路線上,這位藏族青年如今已成為高原復興號動車組資深司機。 資料圖為2021年6月25日,西藏拉林鐵路開通運營,民眾在拉薩火車站與復興號拍照留念。當日,斯朗旺扎系首發司機。記者 江飛波 攝 「我出生在昌都洛隆縣,屬於半農半牧區,小時候騎馬放牛羊,也種過地,割過青稞。」斯朗旺扎說,在洛隆縣中學讀書時,他第一次在課本上看到了火車圖案,當時草原上流傳著青藏鐵路格爾木到拉薩段要開建的消息,「我問老師火車是什麼樣的。」他說,他至今記得初中老師的原話:「火車比你騎的馬快好幾倍。」 2003年初中畢業,斯朗旺扎報考了蘭州鐵路機械學校熱力機車專業。收到錄取通知書後,他踏上了千裡迢迢的求學路:從村裡到鎮上,再坐車到昌都、拉薩,隨後翻過唐古拉山到達青海格爾木。 在格爾木,斯朗旺扎第一次坐上了火車,「當時特別興奮,對火車上的一切都非常好奇」。 2007年畢業後,斯朗旺扎被分配到青藏鐵路西寧機務段擔任機車乘務員學員。「我第一次開火車進藏是2014年,那時我剛從西寧調到格爾木機務段。」斯朗旺扎回憶,當時西藏已經擁有了青藏鐵路,拉日鐵路也開通在即。首次駕駛火車進藏的經歷讓他終生難忘,「非常激動,我們有輪班機制,但那天我幾乎沒休息,像是實現了兒時的夢想。火車翻過唐古拉山後,看到沿路放牧的牧民,草原上的牛羊和藏式民居,感覺特別親切」。 2021年初,西藏拉林鐵路建設進入尾聲,斯朗旺扎迎來駕駛高原復興號動車組的機會。「當年3月,我去蘭州學習復興號動車組的操作,跟車學了半個月。」他回憶,2021年5月,高原復興號正式上線前的試跑階段異常緊張,持續近兩個月的時間裡,幾乎每天都在拉林鐵路和拉日鐵路上試跑。熟悉線路,了解機車性能。 圖為6月20日,斯朗旺扎在高原復興號駕駛室,如今他已成為高原復興號動車組資深司機。記者 江飛波 攝 2021年6月25日,西藏首條電氣化鐵路拉林鐵路正式開通運營,「提前一天晚上就很激動。」他回憶,當天他早早上了車,盤復每個細節。發車後,他在駕駛室看到山南民眾在站臺跳著古老而熱烈的久河卓舞歡迎,中午時分,高原復興號D2021次列車到達林芝站,民眾手捧哈達、載歌載舞熱情迎接。 「到達林芝後,我在車廂裡給我阿媽打了一個電話,阿媽說,她看了直播,並從新聞畫面裡看到了我。」他回憶,阿媽先是稱讚,然後又叮囑他,要開好每一趟火車。 如今,實現兒時夢想的斯朗旺扎經常回到家鄉洛隆縣宣傳鐵路工作,「村裡的小孩對鐵路很感興趣。」他說,這好比當年初中老師給自己種下了「夢想的種子」。 斯朗旺扎也深深感受到鐵路給西藏帶來的巨變:如今鐵路已經覆蓋西藏七市地中的五個,日喀則、林芝、山南等地的民眾和拉薩之間流行起了「雙城」生活。不少遊客選擇乘火車遊覽高原。 值得一提的是,如今斯朗旺扎的家鄉昌都洛隆縣也正在修建鐵路,他充滿期待:「我想未來我應該可以開著火車到洛隆。」(完)
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